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【求助/交流】PCR延伸问题
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fykxy_206
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[交流]
【求助/交流】PCR延伸问题
已有8人参与
在PCR循环中
94预变性
94变性
55退火
72延伸
72延伸10min
这个延伸10min是为什么?是为了更好的延伸吗?能用理论上的东西解释一下吗?
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2010-08-18 16:27:57
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引用回帖:
Originally posted by
yujiaping1
at 2010-08-19 22:45:41:
也许你说的也对,不过我们觉得没反应完的是极少的,不会太影响检测,但这个步骤对下一步的连接反应影响就相对大一些,主要是获得更多的带A的片段
[
Last edited by yujiaping1 on 2010-8-19 at 23:02
]
我的原话是克隆级PCR,也就是后面是用于做克隆的,检测的话我从来就不做补延伸
带不带A,其实假设扩增完整片段的效率一直很高,那么片段都应该很完整而且都带A,我想在瞬间那么0.0x秒之内我相信不会少带那个A这一个碱基而片段都完整。合理的解释应该是,随着循环数的增加,产生不完整片段的数量也会越来越多,可能就差后面那十来个几十个碱基没有延伸完就over了,所以补充延伸的目的就是为了把这些片段给弄完整
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2010-08-19 23:06:49
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amisking(金币+2): 2010-08-18 22:00:39
在做克隆级的PCR的时候,因为Taq酶的活性会随着循环的增加而下降,而且在每一轮循环的过程中部分片段可能没有完全扩增完Taq酶就脱落了
因此为了保证获得大量的完整目的产物,就加了个72℃补延伸,把残余的没反应完的给弄完整了~~
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2010-08-18 16:44:47
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amisking(金币+1):鼓励交流,头像不错! 2010-08-18 22:00:52
这是最后一个循环,把所有的序列恢复成双螺旋结构,以便检测
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2010-08-18 18:17:42
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是保证所有片段扩增完全,但这并不是为了便于检测,其实在延伸那一步我们设定的时间已经基本可以完全扩增了,即使有没扩增完全的极少量片段对检测结果也不会产生多大的影响,主要是影响以后的连接反应
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a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
5楼
2010-08-18 23:07:46
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