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汕头大学海洋科学接受调剂
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gleerat

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助成功】使用脚本做sigma优化,输出为空文件

我把周柱峰的sigma脚本复制下来进行sigma优化,结果comment中没有TS的值:
引用回帖:
0.02
0.04
0.06
0.08

但是直接使用命令,在终端中可以显示TS值:
引用回帖:
hpang@hpang-desktop:~/vasp/sigma$ grep "EENTRO" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }'
   -0.034324

我的sigma脚本的内容为:
引用回帖:
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 0.12 0.14 0.16 0.18 0.20 0.22 0.24 0.26 0.28
do
cat > INCAR < System = CaFe2As2 afm1-opt
PREC = Accurate
ISPIN = 2
MAGMOM = 4*0 3 3 -3 -3 3 -3 -3 3 8*0
ISMEAR = 0
SIGMA = $i
ISTART = 0
EDIFF = 10E-5
ICHARG = 2
ENCUT = 310

LORBIT = 11
LREAL = Auto
!
echo "SIGMA = $i eV" ; time vasp
TS='grep "EENTRO" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }''
echo $i $TS >>comment
done

在执行脚本之后,到要输出TS值的那一步会出现%12.6f \n,: not found的错误提示。
我用一个脚本test测试:
引用回帖:
#!/bin/sh
TS='grep "EENTRO" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }''
echo $TS >>out

终端显示信息与sigma脚本一样的:
CODE:
hpang@hpang-desktop:~/vasp/sigma$ ./test
./test: 2: %12.6f \n,: not found

请教了。谢谢

[ Last edited by gleerat on 2010-8-13 at 18:35 ]
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明察、慎思、笃行
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fanchen021

铁杆木虫 (正式写手)

gleerat(金币+2):谢谢提醒,犯下大错了 2010-08-13 18:23:31
gleerat(金币+8):我经常用prettyswan,所以系统不让评价,金币都给你吧 2010-08-13 18:36:09
侯柱峰                        
2楼2010-08-13 17:01:17
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gleerat

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by fanchen021 at 2010-08-13 17:01:17:
侯柱峰                        

罪过罪过,我给打错字了
明察、慎思、笃行
3楼2010-08-13 18:17:59
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Prettyswan

木虫 (小有名气)


zzy870720z(金币+1):谢谢回复,楼主和你认识吗?呵呵 2010-08-14 08:09:30
引用回帖:
#!/bin/sh
TS='grep "EENTRO" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }''
echo $TS >>out

改为
引用回帖:
#!/bin/sh
TS=`grep "EENTRO" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5 }'`
echo $TS >>out

最外边的是反引号`,
4楼2010-08-13 18:21:56
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