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astrolia

禁虫 (小有名气)


ym23(金币+1):感谢参与讨论 2010-11-30 20:34:05
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11楼2010-08-23 10:30:13
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yindeqiang

银虫 (正式写手)

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zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-08-23 19:47:14
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Originally posted by astrolia at 2010-08-23 10:30:13:

我总觉得测试就是要把所有可能的条件都计算一遍,不理解这样怎么减少计算量,不知道我理解的是不是有问题?

一般需要测试的就是cutoff energy and k-points,其他的参数,比如势函数的选择等等可以根据文献,计算量不大
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12楼2010-08-23 16:11:16
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astrolia

禁虫 (小有名气)

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13楼2010-11-30 15:29:50
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yindeqiang

银虫 (正式写手)

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ym23(金币+1):感谢答疑 2010-11-30 20:35:53
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Originally posted by astrolia at 2010-11-30 15:29:50:

你好,我计算的体系是缺陷体系,而且缺陷还比较大,计算时需要对晶胞进行优化。用能量来做收敛测试的话,是不能选择晶胞优化的。这样的话,收敛测试结果是否可信呢?

我的理解是,收敛测试是针对你计算所用参数的,因此在测试的时候,不能选择晶格优化(排除晶格的影响),只考虑参数的误差。一般对于体系的参数测试,都会选择常用的体材料等等,参数收敛后,在利用前计算得到的常见材料参数,比如晶格常数等,可以与已有的结果进行比较,说明计算及参数的可信度,然后可以应用到含缺陷的体系的计算之中
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14楼2010-11-30 20:18:41
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ym23

铁杆木虫 (著名写手)


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Originally posted by cenwanglai at 2010-08-03 13:23:24:
需要测试一下.特别是计算自己不熟悉的东西.大体系的模型是从小体系开始建模型的.就从小体系开始测试,比如k点密度,截断能什么的.这些有移植性的.小体系下测试了,在大体系下可以用.

大体要测试的,是真空层厚度,原 ...

为什么说有移植性呢?结构都变了,K点和阶段能不用变吗?
博观约取、厚积薄发---壁立千仞、无欲则刚
15楼2010-11-30 20:37:54
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yindeqiang

银虫 (正式写手)

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ym23(金币+1):没事,我就是问问,我也不是很懂的 2010-11-30 22:17:08
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Originally posted by ym23 at 2010-11-30 20:37:54:



为什么说有移植性呢?结构都变了,K点和阶段能不用变吗?

感谢版主的纠正,的确对不同的结构,所用的k-points和截断能是不同的,每一部分都要独立测试。
在我的计算中,刚刚说的移植性,指的是其他的参数,GGA/PW91的选取,等等。
希望不要对楼主引起误导
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16楼2010-11-30 22:14:38
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xiaohunhun

木虫 (著名写手)

珊瑚岛混混,小元家老末


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Originally posted by yindeqiang at 2010-11-30 20:18:41:

我的理解是,收敛测试是针对你计算所用参数的,因此在测试的时候,不能选择晶格优化(排除晶格的影响),只考虑参数的误差。一般对于体系的参数测试,都会选择常用的体材料等等,参数收敛后,在利用前计算得到的常 ...

请教一下,
(1)您所说的晶格优化是指优化整个晶胞使晶格参数变化(超胞结构改变),还是在优化晶格参数的同时优化内坐标?
(2)您的意思是不几何优化结构直接计算能量,只要能收敛就可以了?通过比较参数找出最优结果?这样就是完成了收敛性测试?
(3)对于收敛性测试我一直很迷惑,不知道具体原因。可不可以这样理解:有多数文献指导的类似结构,就可以采用公认的参数,要是一个新的结构,就要采用收敛性测试。
(4)提到收敛性测试的人我认识的都是做VASP或者QE的,而在MS中我个人一般是设好参数(来自文献),逐步提高结构优化精度,粗糙-中等-fine,只要结构能优化我就认为该结构可行。如果几何优化不收敛我就认为该结构不存在,由于我做的东西很常见(方法&参数),一般没有出现过要求收敛性测试的问题。不知道这个流程对不对。
(5)请教一下您最早看见关于收敛性测试的要求来自哪里,包括软件的manual, user guide等等都可以,说一下出处,我想查看一下啊,谢谢。

[ Last edited by xiaohunhun on 2010-12-1 at 09:41 ]
1.天天大脑风暴很重要。2.这个世界最可怕的不是很多人比你牛逼,而是比你牛逼的人还比你努力!3.If you don't run fast,you will get trampled
17楼2010-12-01 09:39:39
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astrolia

禁虫 (小有名气)

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18楼2010-12-01 09:56:27
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yindeqiang

银虫 (正式写手)

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zzy870720z(金币+5):谢谢指教 2010-12-02 23:16:50
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Originally posted by xiaohunhun at 2010-12-01 09:39:39:

请教一下,
(1)您所说的晶格优化是指优化整个晶胞使晶格参数变化(超胞结构改变),还是在优化晶格参数的同时优化内坐标?
(2)您的意思是不几何优化结构直接计算能量,只要能收敛就可以了?通过比较参数找 ...

xiaohunhun 太客气了,谈不上请教,相互交流一下,我只是说一下自己的看法,如果有不对的地方,还希望像版主一样指出
(1). 我所说的几何优化,具体到castep中为Geometry Optimization,几何优化时,castep通过微调原子坐标使能量最低,当然你可以选择是否优化晶格,但对于计算参数(主要是cut off energy and k-points)的收敛测试,主要是测试计算参数对能量计算的影响,因此不需要优化结构;
(2).参数收敛测试的目的是:既能准确的计算能量,又使计算量最低。从这个目的出发,在收敛测试时,根据相关文献,比如测试k-points,先选取一较大的cut-off,然后把k-points依次从低到高,将计算的结果与k-points最高的值进行比较(一般认为k-points等越高,越接近于真实情况,但计算量相对也增加),如果能量收敛了——符合收敛标准,那就认为测试完成;
(3).对于收敛性测试的原因,除了为了上面的目的外,个人觉得,还在于,对于不同的计算环境(机器等),就算相同的设置,计算结果也会有些许差异(当然差异肯定不大),但自己测试下放心一点。可以采用公认的参数,但多数文献,在介绍计算方法的时候都会提到,参数经过收敛测试。
(4).虽然我是用ms计算,但指导我的导师是用vasp的,因此我用的计算过程还是符合vasp,但都是第一原理的计算,自己测试一下参数,既能达到收敛,又能把计算量降到最小,文献的内容可以作为自己选取参数的依据,对于你提到的方法,还请其他虫友说说
(5).对于收敛测试在文献 介绍计算方法或者什么的时候,会提到测试通过收敛测试,对于你说的要求指的是?收敛标准的话,文献中都会给出,至于是否必须测试,这个也不一定吧,像你做的东西常见,那么参数都是测试过的,可以直接用。
以上的回答,还请兄弟姐妹们,多指正。
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19楼2010-12-01 18:29:09
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yindeqiang

银虫 (正式写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-12-02 23:17:02
引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-12-01 09:56:27:

也就是说对于k点和截断能,其实不能用完整晶格的参数,这个我明白,毕竟有了缺陷,体系结构不同。可是我建的模型需要进行晶胞的优化。那么该怎么做收敛性测试呢?

测试完了,再用测试的参数优化,这个不冲突吧
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20楼2010-12-01 18:30:16
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