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liuxianlv

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS的Amorphous cell使用出问题已有6人参与

各位大哥大姐请教个问题:
   我想用MS的Amorphous cell建个含水和有机分子的体系,再用build-layer加到金属表面。建不起来,我分子是用高斯优化的,然后用GV另存为MOL引入MS的,水是直接在MS中画的再minimize得,只建含200水分子可以建。出如下错误。谢谢各位!




点YES出现下图

再点YES


[ Last edited by liuxianlv on 2010-7-25 at 10:07 ]
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第一性原理 Amorphous cell

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qasd

木虫 (著名写手)


zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-07-26 08:25:03
MS画有机分子,水。分配compass力场,AC建盒子就行了,没有必要用高斯,这有点像用一电锯去吃牛排
7楼2010-07-26 07:51:58
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★
zzy870720z(金币+2):谢谢指导 2010-07-26 13:10:35
liuxianlv(金币+5):谢谢 2010-10-05 16:46:18
如果下一步要使用量子力学研究,值得这么做。
另外,如果你下一步要build layer的话,建议建cell而不是confined layer
9楼2010-07-26 12:29:44
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qasd

木虫 (著名写手)


zzy870720z(金币+1):谢谢指导 2010-07-29 08:37:56
liuxianlv(金币+2):谢谢 2010-10-05 16:46:55
证明ms不能自动分配相应的原子力场参数,手动查看一下,如果有手动指定
13楼2010-07-27 18:49:10
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