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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta并行老是会死
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smartly

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】siesta并行老是会死 已有3人参与

请问我用的siesta并行计算，每次算几个小时会停掉。。然后只能继续提交作业。。。想问问是什么原因呢？？（比如并行时需注意什么？设置什么参数会好一些呢？）
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1楼 2010-07-22 09:04:18
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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★
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-07-22 09:18:04
smartly(金币+1): 2010-07-23 11:23:23
不用siesta
楼主是直接提交的还是用PBS提交的
不太清楚你怎么交作业的
以前用PBS指定作业的时间出现过这种情况
不知道楼主是不是这个情况
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-07-22 09:17:24
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
aylayl08(金币+1):谢谢热心提示 2010-07-22 16:30:15
引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-07-22 02:04:18:
请问我用的siesta并行计算，每次算几个小时会停掉。。然后只能继续提交作业。。。想问问是什么原因呢？？（比如并行时需注意什么？设置什么参数会好一些呢？）

把任务的提交方式和停掉之后出现的最后几行的输出给出来，这样方便大家帮你出主意！
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弘德明志博学笃行
3楼2010-07-22 09:26:01
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smartly

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-07-22 09:04:18:
请问我用的siesta并行计算，每次算几个小时会停掉。。然后只能继续提交作业。。。想问问是什么原因呢？？（比如并行时需注意什么？设置什么参数会好一些呢？）

是用pbs提交的。。。
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4楼2010-07-22 18:11:04
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smartly

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-07-22 09:17:24:
不用siesta
楼主是直接提交的还是用PBS提交的
不太清楚你怎么交作业的
以前用PBS指定作业的时间出现过这种情况
不知道楼主是不是这个情况

是用pbs提交的作业。。。
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5楼2010-07-22 18:12:51
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zzy870720z

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lvjian8596(金币+2):感谢交流！ 2010-07-23 11:18:59
引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-07-22 18:12:51:

是用pbs提交的作业。。。

set queue batch resources_default.walltime = 1440:00:00
看一下上面这个东西是不是默认的太短了
需要修改一下
如果是torque PBS的话
可以在脚本里写上
#PBS -l walltime=999:00:00
应该就可以了
楼主试试
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
6楼2010-07-22 19:58:28
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smartly

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-07-22 19:58:28:


set queue batch resources_default.walltime = 1440:00:00
看一下上面这个东西是不是默认的太短了
需要修改一下
如果是torque PBS的话
可以在脚本里写上
#PBS -l walltime=999:00:00
应该就可以了
楼 ...

这个时间我设置的600，足够了呢。。。
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7楼2010-07-23 11:18:06
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主
引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-07-23 11:18:06:



这个时间我设置的600，足够了呢。。。

那就不是这个问题了
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
8楼2010-07-23 11:19:08
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smartly

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-22 09:26:01:

把任务的提交方式和停掉之后出现的最后几行的输出给出来，这样方便大家帮你出主意！

用pbs提交的，结束后有个报错文件，一般是说recieve的信息低于多少，MPI怎么怎么了。。。我不小心把该文件删了，大概是这样子。。。是不是并行计算不稳定啊。。
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9楼2010-07-23 11:21:58
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
内容已删除
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弘德明志博学笃行
10楼2010-07-23 11:58:38
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