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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】siesta并行老是会死
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smartly

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-23 11:58:38:

你尝试着不用pbs提交任务看一下！

貌似我们这里必须要用pbs来提交。。。
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11楼2010-07-24 18:46:23
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
smartly(金币+3): 2010-08-08 10:10:53
引用回帖:
Originally posted by smartly at 2010-07-24 11:46:23:



貌似我们这里必须要用pbs来提交。。。

能绕过去吧！直接上去就用普通的提交方式。我们这儿有一个集群组使用的PBS，我可以不用它直接提交任务，只不过提交的任务在PBS系统里看不到。所以有时候别人以为那个节点空着，实际上已经算上东西了。
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弘德明志博学笃行
12楼2010-07-24 18:57:56
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louazhao

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
13楼2011-04-13 18:50:33
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漂浮的萸

金虫 (小有名气)

siesta进行ordern计算出错求助

Warning: Bad load balancing: no cells allocated to node           1
Try specifying a number of nodes that is
an exact factor of the number of cells:          32
ERROR STOP from Node:    0
ERROR STOP from Node:    0
--------------------------------------------------------------------------
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD
with errorcode 1.

NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.
You may or may not see output from other processes, depending on
exactly when Open MPI kills them.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 0 with PID 17012 on
node node1 exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
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14楼2011-04-14 14:29:39
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
franch(金币+2): 别太激动，，和谐，和谐。。呵呵。。 2011-04-14 19:28:31
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-07-24 18:57:56:
能绕过去吧！直接上去就用普通的提交方式。我们这儿有一个集群组使用的PBS，我可以不用它直接提交任务，只不过提交的任务在PBS系统里看不到。所以有时候别人以为那个节点空着，实际上已经算上东西了。

.....大部分集群除了部分做了开发禁止MPIRUN任务运行程序都可以绕过调度系统的
但你老兄这个做法太邪恶了吧
明显是插队还如此自以为傲

之前并行死不死呢？
小的程序死不死呢？
其他的软件并行死不死呢？
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九州浩淼，任其东西，明日何在，但随我意。
15楼2011-04-14 16:39:04
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
franch(金币+1): 别太激动，，和谐，和谐。。呵呵。。 2011-04-14 19:29:51
引用回帖:
Originally posted by 风间的记忆 at 2011-04-14 09:39:04:
.....大部分集群除了部分做了开发禁止MPIRUN任务运行程序都可以绕过调度系统的
但你老兄这个做法太邪恶了吧
明显是插队还如此自以为傲

之前并行死不死呢？
小的程序死不死呢？
其他的软件并行死不死呢？

我什么时候如此自以为傲了。我只是让他这样试试是不是PBS的问题。说话也太不。。。。
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弘德明志博学笃行
16楼2011-04-14 16:47:52
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风间的记忆

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2011-04-14 16:47:52:
我什么时候如此自以为傲了。我只是让他这样试试是不是PBS的问题。说话也太不。。。。

好吧。。我激动了。。
对于错误的说法我表示表示道歉
不过这种做法的确不太和谐
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九州浩淼，任其东西，明日何在，但随我意。
17楼2011-04-15 09:09:35
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 风间的记忆 at 2011-04-15 02:09:35:
好吧。。我激动了。。
对于错误的说法我表示表示道歉
不过这种做法的确不太和谐

那道不是说必须得道歉。我当时给她说这个办法只是想让她找一下不能并行的原因。并不是说让她以后这么做。如果实际计算中这么做，确实是不和谐的。
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弘德明志博学笃行
18楼2011-04-15 09:22:41
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