应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于相对定量的重复板数据处理
51/1返回列表
查看: 1019  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zephyr0911

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于相对定量的重复板数据处理 已有3人参与

各位好！

最近我在做的实验是这样的，一共做10个基因。每个板上做3个（包括一个参照，实际是两个）。我发现同样的基因在不同板上跑出来的结果很不一样，包括有两个连趋势都不一样，有些是表达量差异很大，几十倍的差异。请问我最后想要把这些所有基因整合到一张图上去，这些不同板上重复的数据我怎么处理呢？还有这种板之间的差异正常吗？

PS 我用的SYBR染料，ROCHE LIGHT机子。

谢谢大家了！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2010-07-20 09:43:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zephyr0911

新虫 (小有名气)
谢谢您的回答。还有个问题，就是如果我们要将相对表达量差异很多的基因做到一个图上。如GeneA 表达范围是0.1-1.0，而GeneB表达范围是100-500，那通过什么软件做比较好？做到既美观又直观呢？

谢谢！
赞一下 回复此楼
5楼2010-07-20 13:27:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

lwiaanngg

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
如果同一基因在不同板上差距在几十倍是不正常的，按理来说板之间不应该有这么大的差距。3~5倍都是有可能的，但几十倍过大了
建议重新做实验来确认数据。毕竟连你自己都觉得有问题的数据，还是谨慎处理为好。
你的PCR条件是否是优化过的，而且用sybr时，你的melting curve质量如何？
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-07-20 10:31:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zephyr0911

新虫 (小有名气)
谢谢您的回答！溶解曲线很好，您所说的PCR条件优化具体指的是什么？望赐教！

还有像板之间的差异最后整合成一个图的时候数据具体怎么处理，是选择自己觉得好的？还是取个平均值啥的？
赞一下 回复此楼
3楼2010-07-20 10:37:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
板之间要加入一个标准来扣除每次的误差哦
我是把cDNA分装成一次用量的小份放在-80保存，每次拿一管出来扩3孔内参，当标准品来使

另外做实时定量一定要用进口的枪头，用同一套枪，最好同一个人混样，每次点样的位置都一样，这样误差就能减小不少

还有就是复孔之间的标准差有多大呢？如果是因为标准差大导致均数差异大那么其实还是个均一性的问题
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-07-20 10:44:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-10 01:40 by FChKX8meu1ds
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭