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ahjx

[交流] 【求助/交流】求助多态性分析方法的选择 已有2人参与

各位前辈们,小弟想问下在做某个基因多态性分析时,有四种方法可以选择:SSCP、RFLP、HMA、DGGE。但是为什么在我看到的文献中做多态分析的都用的是前两种方法。

1、我想知道他们四个之间的差别,在什么情况下选择什么方法?
2、关于SSCP,文献里说加入5%-10%的甘油能增加分辨率,使条带更清晰,但是该在什么时候加这个是个问题。

                                                           谢谢前辈们!
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darymellon

金虫 (小有名气)


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我比较熟悉RFLP和DGGE,RFLP工作量大,但是相当于文库的构建,会比较全面;DGGE一次可以分析十几个样品,效率高。要是从这两个方法中选择的话,就看你的样品数量了!
2楼2010-07-04 10:00:48
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ahjx

引用回帖:
Originally posted by ahjx at 2010-07-04 09:12:42:
各位前辈们,小弟想问下在做某个基因多态性分析时,有四种方法可以选择:SSCP、RFLP、HMA、DGGE。但是为什么在我看到的文献中做多态分析的都用的是前两种方法。

1、我想知道他们四个之间的差别,在什么情况下选 ...

那就是,样品量少的情况下选择DGGE,要是量大的话选择RFLP吗?那还有关于加甘油的问题你知道吗?
3楼2010-07-04 10:11:02
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darymellon

金虫 (小有名气)

★ ★
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dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-07-04 12:09:10
不是,当你分析的样品少时,比如3-5个,可以选择RFLP,当你的样品有十几个二十几个时就选择DGGE吧
4楼2010-07-04 11:17:11
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