24小时热门版块排行榜    

查看: 2747  |  回复: 5

ter20

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问虚原子和空原子的区别 已有5人参与

一直不清楚虚原子(dummy atom)和空原子(ghost atom)的区别,也不清楚各有什么用途,麻烦知情者给些指点吧,谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯计算总结 好书

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):谢谢,希望还想知道空原子除了做BSSE还有什么用途 2010-06-28 11:26:00
虚原子(dummy atom)只是为了构建分子z-matrix坐标用的,不影响体系能量。。
空原子(ghost atom)不仅提供坐标,还提供基函数,参与和影响分子的能量运算,主要是用来做BSSE校正的。。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-06-28 11:20:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):多谢啦,回答的好详细 2010-06-28 13:06:20
dummy atom是空间的一个点,这个点本没有原子,只是为了定义坐标(一般是z矩阵)方便才加入的。例如,为了避免180度二面角产生的问题,就需要加入dummy atom。dummy atom不影响对称性。

ghost atom有对应的真实原子(例如C、H、O),区别在于,ghost atom所在的位置没有原子所对应的原子核和电子,但是由于存在以ghost atom为中心的基函数,所以在分子体系中会有少量的电子分布。ghost atom通常用来做BSSE矫正。

[ Last edited by beefly on 2010-6-28 at 11:29 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2010-06-28 11:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjuZidan

木虫 (小有名气)


ter20(金币+1):谢谢参与
to 楼上:虚原子是为了避免180°的键角,不是二面角
别以后想起又是遗憾
4楼2010-06-28 15:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaocat

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
用虚原子避免180角的情况时,虚原子的原子编号不能在最后一位。是有这样的说法吗?为什么呢
飞蛾扑火
5楼2011-06-02 13:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

海边的风

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问MS里怎么设置dummy atoms,求具体步骤
只要自己尽力了,就一切ok了,无论成功与否
6楼2014-12-18 15:26:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ter20 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 +5 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 6/300 2026-03-02 09:36 by 破风α
[考研] 材料学调剂 +10 提神豆沙包 2026-02-28 12/600 2026-03-02 09:26 by 李老师!
[考研] 材料工程269求调剂 +3 白刺玫 2026-03-02 3/150 2026-03-02 09:25 by 一休哥FU
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 0805总分292,求调剂 +7 幻想之殇 2026-03-01 7/350 2026-03-01 21:22 by 公瑾逍遥
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 寻找调剂 +4 LYidhsjabdj 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:56 by sunny81
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
信息提示
请填处理意见