24小时热门版块排行榜    

查看: 3070  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ter20

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问虚原子和空原子的区别 已有5人参与

一直不清楚虚原子(dummy atom)和空原子(ghost atom)的区别,也不清楚各有什么用途,麻烦知情者给些指点吧,谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯计算总结 好书

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaocat

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
用虚原子避免180角的情况时,虚原子的原子编号不能在最后一位。是有这样的说法吗?为什么呢
飞蛾扑火
5楼2011-06-02 13:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):谢谢,希望还想知道空原子除了做BSSE还有什么用途 2010-06-28 11:26:00
虚原子(dummy atom)只是为了构建分子z-matrix坐标用的,不影响体系能量。。
空原子(ghost atom)不仅提供坐标,还提供基函数,参与和影响分子的能量运算,主要是用来做BSSE校正的。。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-06-28 11:20:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):多谢啦,回答的好详细 2010-06-28 13:06:20
dummy atom是空间的一个点,这个点本没有原子,只是为了定义坐标(一般是z矩阵)方便才加入的。例如,为了避免180度二面角产生的问题,就需要加入dummy atom。dummy atom不影响对称性。

ghost atom有对应的真实原子(例如C、H、O),区别在于,ghost atom所在的位置没有原子所对应的原子核和电子,但是由于存在以ghost atom为中心的基函数,所以在分子体系中会有少量的电子分布。ghost atom通常用来做BSSE矫正。

[ Last edited by beefly on 2010-6-28 at 11:29 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2010-06-28 11:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjuZidan

木虫 (小有名气)


ter20(金币+1):谢谢参与
to 楼上:虚原子是为了避免180°的键角,不是二面角
别以后想起又是遗憾
4楼2010-06-28 15:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +11 Kittylucky 2026-08-27 12/600 2026-08-28 16:26 by lyxiaomc
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +12 晴天加油 2026-08-26 13/650 2026-08-28 11:32 by skyjudy
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见