24小时热门版块排行榜    

查看: 3062  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

ter20

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】请问虚原子和空原子的区别 已有5人参与

一直不清楚虚原子(dummy atom)和空原子(ghost atom)的区别,也不清楚各有什么用途,麻烦知情者给些指点吧,谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯计算总结 好书

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjuZidan

木虫 (小有名气)


ter20(金币+1):谢谢参与
to 楼上:虚原子是为了避免180°的键角,不是二面角
别以后想起又是遗憾
4楼2010-06-28 15:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):谢谢,希望还想知道空原子除了做BSSE还有什么用途 2010-06-28 11:26:00
虚原子(dummy atom)只是为了构建分子z-matrix坐标用的,不影响体系能量。。
空原子(ghost atom)不仅提供坐标,还提供基函数,参与和影响分子的能量运算,主要是用来做BSSE校正的。。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-06-28 11:20:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


ter20(金币+1):谢谢参与
ter20(金币+1):多谢啦,回答的好详细 2010-06-28 13:06:20
dummy atom是空间的一个点,这个点本没有原子,只是为了定义坐标(一般是z矩阵)方便才加入的。例如,为了避免180度二面角产生的问题,就需要加入dummy atom。dummy atom不影响对称性。

ghost atom有对应的真实原子(例如C、H、O),区别在于,ghost atom所在的位置没有原子所对应的原子核和电子,但是由于存在以ghost atom为中心的基函数,所以在分子体系中会有少量的电子分布。ghost atom通常用来做BSSE矫正。

[ Last edited by beefly on 2010-6-28 at 11:29 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2010-06-28 11:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lixiaocat

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
用虚原子避免180角的情况时,虚原子的原子编号不能在最后一位。是有这样的说法吗?为什么呢
飞蛾扑火
5楼2011-06-02 13:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 8/400 2026-08-25 05:12 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-24 21:59 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见