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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】计算振动模式
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lovemydog

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】计算振动模式 已有6人参与

想研究一下分子的振动模式，得到其各个原子的振动频率和振幅，请问一下是不是用Dmol3对其进行几何优化时，性质里勾选“frequency”，这个得到的频率能相应的对应到各个原子么？如果对应不到该选用那个模块进行计算？另外分子中原子的振幅该怎么算？通过红外谱图么？
  先谢谢大家了
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1楼 2010-06-25 14:32:56
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haishuihan

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
lovemydog(金币+1): 谢谢参与
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-07-01 23:55:20
引用回帖:
5楼: Originally posted by yjmaxpayne at 2010-06-26 16:28:41
你需要先把频率计算好（可以用VAMP这个半经验的包试手），之后在最上面的Tools里面，找到Vibrational Analysis就可以进行频率的分析了。

我用Dmol计算氨基酸晶胞的振动，只得到了频率，没有强度。看了http://muchong.com/html/201012/2718325.html，但是对于如何计算偶极矩导数矩阵还是不太清楚。晶体的振动强度你了解怎么手动计算吗
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10楼2013-07-01 09:42:19
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identation

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lvjian8596(金币+1):感谢交流！鼓励发有价值的话题！ 2010-06-25 15:29:47
lovemydog(金币+1): 2010-06-26 09:14:23
振动模式特征频率对应的不是原子呀，是两个原子间的振动，比如伸缩振动，弯曲振动等等
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2楼2010-06-25 15:18:44
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yjmaxpayne

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
hedaors(金币+1):Thanks 2010-06-25 18:54:47
lovemydog(金币+3): 2010-06-26 09:14:33
性质勾选Frequency， 之后在tools -> vibrational Analysis可以得到红外光谱以及各个模式的振动情况。

振动幅度可以在option里面设置，是人为控制的一个参数。

红外光谱的强度在vibrational Analysis里面可以直接得到。
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3楼2010-06-25 18:45:19
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lovemydog

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yjmaxpayne at 2010-06-25 18:45:19:
性质勾选Frequency， 之后在tools -> vibrational Analysis可以得到红外光谱以及各个模式的振动情况。

振动幅度可以在option里面设置，是人为控制的一个参数。

红外光谱的强度在vibrational Analysis里面 ...

具体怎么操作，麻烦您能讲下么？刚学，没做过。谢谢啊
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4楼2010-06-26 09:16:28
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