应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列
181/2返回列表12下一页
查看: 2377  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

heihei3910

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】请高人帮我详尽的分析一段DNA序列 已有12人参与

请高人帮我详尽的分析一段DNA序列。
我的这段DNA序列是利用兼并引物从一个放线菌的基因组DNA中扩增出来的。
希望高人能非常详尽的分析一下这段序列与哪个基因同源性最高？保守序列在哪里？有保守结构域吗？同时能够与最同源的一些做个聚类分析。总之是越详细越好。

灌水的不要啊！！！

ATTCCACTGGGCGCCATGGCCGGAAAACTTCACCGAGTCGTAGTTGGTGCCGAAGGCCCCCGCGTCGACCAGTTCCCTGATCTTGCCCAACGCCTTGCGGCTGTCCGGGCTCGCCCAGACCTCCCGGTCGCCCGCGAGCGCCTTCTCGAAGAGTTCCGGGCCGGCGATGCGGTCGTAGAGGTACTCGAACCACATCAGTGTCGGCCACCGGTCGCCGCCGCCCAGCGCGATCGGGGTGACGCCGTCCGACTTCAGCGCTTTGACCGCCGCGAGCAGGTCGTCCCAGGTCTCGGGCGGTTCGACGCCCGCCTTCTTCAGGACCTTGCCGTTGTGGGAGAGCAGCACGGGCTGCGTCCCGCGCATGGGGACCCCGTAGGAGGCGCCGTCGACCACCGCGCTGTTGAAGACGGACGGCAGGAACTTCTCCTTGAGGGCGGGGTCCTCCTCGATGAACGGGTCCAGCGGGAGCAACAGGTCGGCGTCGACGAACGGCTTGATGCTGCCGCCGCCCCAGTTGAAGAAGACGTCGGACGCCTGCTTGCTGTTGATGATCGTCTGGAGTTTGGCCTGGTAGTCGGCGCCCGGGATGGTGTCCAGGACGGCCTTCACCTTCGACGTCTTGTTGAAGGTGGCGACGATCTCCTTCTCCACCTTGTTCGCCGCGTCCCCGTCCCGTGCGCCTCAAT
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-06-24 20:13:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlus1632

木虫 (正式写手)
直接用ncbi里的blast分析就可以拉
赞一下 回复此楼
2楼2010-06-24 20:31:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuyixst

木虫 (正式写手)
这个不用高手就可以
赞一下 回复此楼
3楼2010-06-24 20:37:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)
★
lstt09nk(金币+1):呵呵，感觉像丢东西似的~~ 2010-06-29 19:05:47
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome

序列丢进去，database选others，点最下边的BLAST，等结果吧
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-06-24 20:42:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heihei3910

铜虫 (小有名气)

你们给的并不是我要的答案

你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？
赞一下 回复此楼
5楼2010-06-24 21:09:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
scelab(金币+3):谢谢交流！:tiger06: 2010-06-24 23:38:18
引用回帖:
Originally posted by heihei3910 at 2010-06-24 21:09:39:
你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？

什么叫怎么搞？
”详尽的分析“指什么？不说清楚没办法

最简单的，blast结果里面找到相似度高的序列，然后拿到这些序列
clustalW比对对齐，分析同源区
MEGA建树

具体做什么东西要看你的目的了，找本生物信息的书看，上面都有
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-06-24 21:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

scelab

荣誉版主 (文坛精英)

小木虫之有关部门负责人
引用回帖:
Originally posted by heihei3910 at 2010-06-24 21:09:39:
你们给的并不是我要的答案
去NCBI里比对我也非常熟悉，我的意思是，比对完了后，确实有同源性很高的序列，然后调出该序列后，继续详尽的分析，怎么搞？

你的要求貌似比较高。

要满足你的要求的，得对你研究的菌背景有所了解~~~或者同行
赞一下 回复此楼
小木虫之有关部门负责人
7楼2010-06-24 23:39:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主
★
看天(金币+1):很活跃的虫友～～～ 2010-06-29 18:06:38
  你的要求太高了 至少得浪费别人半天时间
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-06-25 08:18:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)
这，这要半天，分析好的话，给钱~！
赞一下 回复此楼
9楼2010-06-25 17:01:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

heihei3910

铜虫 (小有名气)
你们这些家伙都是在这里放大话，具体的啥也说不清楚，还赖别人没有表达清楚，服了你们了啊！！！！！！
赞一下 回复此楼
10楼2010-06-29 17:55:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 heihei3910 的主题更新
181/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 高分子化学与物理调剂 +4 好好好1233 2026-02-28 7/350 2026-02-28 20:42 by 好好好1233
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[考研] 284求调剂 +3 天下熯 2026-02-28 3/150 2026-02-28 20:14 by 公瑾逍遥
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[考研] 311求调剂 +7 南迦720 2026-02-28 7/350 2026-02-28 18:28 by leonnulll
[考研] 材料学调剂 +4 提神豆沙包 2026-02-28 4/200 2026-02-28 18:26 by houyaoxu
[教师之家] 版面费该交吗 +15 苹果在哪里 2026-02-22 18/900 2026-02-28 18:20 by mibaomingg
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂；
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +3 repeatt?t 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:00 by houyaoxu
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +4 礼堂丁真258 2026-02-28 6/300 2026-02-28 16:18 by 求调剂zz
[考博] 26申博 +3 想申博！ 2026-02-26 3/150 2026-02-28 16:07 by nxgogo
[考研] 290求调剂 +4 材料专硕调剂； 2026-02-28 5/250 2026-02-28 13:32 by houyaoxu
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
[考研] 寻找调剂 +3 LYidhsjabdj 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:59 by miniwendy
[考研] 272求调剂 +3 田智友 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:31 by 王加浩to
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭