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triiawypm

银虫 (正式写手)

[交流] 【请教】请教一下SAME命令的使用.已有3人参与

请教一下,下面网址的这个例子中,这句话是什么意思:
SAME makes the 1,2- and 1,3-distances equivalent (start two atoms earlier to catch all possible 1,3-distances; make sure that the atoms are all in the right order!).

1,2-和1,3-distances是指哪个? 怎么还提前两个原子? 那这SAME命令到底限制了谁和谁的距离相同? 谢谢了.

http://shelx.uni-ac.gwdg.de/~peterm/tutorial/do-ga.htm
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triiawypm

银虫 (正式写手)

顶一下.
2楼2010-06-25 09:28:57
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triiawypm

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-25 11:29:46:
比如N-C-O结构,N...O距离是1,3;N-C和C-O是1,2
1,3和1,2距离同时固定后,键长键角也就同时固定了

start two atoms是same列表里的头2个原子

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-25 at 12:30 ]

没明白啊, 怎么叫固定啊? SMAE N C O 的话能起到什么作用,固定是固定多少值啊? 还是说SAME需要和另外一组SAME同时使用,
比如说: SAME N1 C1 O1
....
....
后面还有一个SAME N2 C2 O2
那这样就固定N1-C1 = N2-C2, N1-O1 = N2 - O2, C2 -O2 = C1 - O1?
是这样吗?
5楼2010-06-25 13:50:18
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triiawypm

银虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-25 14:07:31:

你说的固定的正确格式是这样的:
SAME N1 C1 O1
N2
C2
O2

嗯?我看错了,不好意思.你的意思是SAME下面的和后面跟着的是不一样的?
7楼2010-06-25 14:43:40
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triiawypm

银虫 (正式写手)

帝夫:感谢回帖交流! 2010-06-26 09:14:47
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-25 15:27:51:
1楼那个网址,ga-03.res文件中,有个例子:
same ga2 c14 c15b
GA2   5    0.445618    0.809818    0.031361    11.00000    0.01795
C14   1    0.423036    0.664284   -0.020920    11.00000    0.03428
...

我并不是问两套SAME配套使用会怎么样.我只是想问一套SAME起到什么用.你说的固定是指以后在精修过程中这个长短和角不变了吗? 那句话:SAME makes the 1,2- and 1,3-distances equivalent说使得12和13键长等价?谁和谁等价?限制C15b是什么意思?C15a呢?
我看过这个例子,没有明白,SAME在这里起到了什么作用,于是就发了这个帖子.
11楼2010-06-25 17:26:10
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