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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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triiawypm

银虫 (正式写手)

[交流] 【请教】请教一下SAME命令的使用. 已有3人参与

请教一下,下面网址的这个例子中,这句话是什么意思:
SAME makes the 1,2- and 1,3-distances equivalent (start two atoms earlier to catch all possible 1,3-distances; make sure that the atoms are all in the right order!).

1,2-和1,3-distances是指哪个? 怎么还提前两个原子? 那这SAME命令到底限制了谁和谁的距离相同? 谢谢了.

http://shelx.uni-ac.gwdg.de/~peterm/tutorial/do-ga.htm
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1楼 2010-06-24 16:35:34
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triiawypm

银虫 (正式写手)
顶一下.
2楼2010-06-25 09:28:57
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸
triiawypm(金币+1):谢谢帮顶. 2010-06-25 10:34:30
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-06-25 14:45:41
期待高手出现
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3楼2010-06-25 10:29:25
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★
triiawypm(金币+3):谢谢, 还是没明白. 2010-06-25 13:51:45
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-06-25 14:46:08
triiawypm(金币+4):哈哈,不好意思.这个帖子我没问清楚,金币给你吧,我新开了一个帖子,希望得到你的帮助.http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=2170440&fpage=1 2010-06-25 17:40:19
比如N-C-O结构，N...O距离是1,3；N-C和C-O是1,2
1,3和1,2距离同时固定后，键长键角也就同时固定了

start two atoms是same列表里的头2个原子

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-25 at 12:30 ]
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4楼2010-06-25 11:29:46
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triiawypm

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-25 11:29:46:
比如N-C-O结构，N...O距离是1,3；N-C和C-O是1,2
1,3和1,2距离同时固定后，键长键角也就同时固定了

start two atoms是same列表里的头2个原子

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-25 at 12:30 ]

没明白啊, 怎么叫固定啊? SMAE N C O 的话能起到什么作用,固定是固定多少值啊? 还是说SAME需要和另外一组SAME同时使用,
比如说: SAME N1 C1 O1
....
....
后面还有一个SAME N2 C2 O2
那这样就固定N1-C1 = N2-C2, N1-O1 = N2 - O2, C2 -O2 = C1 - O1?
是这样吗?
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5楼2010-06-25 13:50:18
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hao_jian

木虫 (正式写手)
triiawypm(金币+2):嗯,是那样的, 我想知道这个命令是需要两个SAME配套使用吗? 2010-06-25 14:42:42
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-06-25 14:46:31
引用回帖:
Originally posted by triiawypm at 2010-06-25 13:50:18:


没明白啊, 怎么叫固定啊? SMAE N C O 的话能起到什么作用,固定是固定多少值啊? 还是说SAME需要和另外一组SAME同时使用,
比如说: SAME N1 C1 O1
....
....
后面还有一个SAME N2 C2 O2
那这样就固定N1-C1  ...

你说的固定的正确格式是这样的：
SAME N1 C1 O1
N2
C2
O2
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6楼2010-06-25 14:07:31
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triiawypm

银虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by hao_jian at 2010-06-25 14:07:31:

你说的固定的正确格式是这样的：
SAME N1 C1 O1
N2
C2
O2

嗯?我看错了,不好意思.你的意思是SAME下面的和后面跟着的是不一样的?
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7楼2010-06-25 14:43:40
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hao_jian

木虫 (正式写手)
★ ★
帝夫(金币+2):感谢回帖交流！ 2010-06-26 09:14:20
为了固定N1-C1 = N2-C2, N1-O1 = N2 - O2, C2 -O2 = C1 - O1
正确格式是这样的：
SAME N1 C1 O1
N2
C2
O2

"两个same配套使用"不合格式，会导致精修乱套的。

除非你要固定3个相同基团，用下面格式

SAME N1 C1 O1
SAME N2 C2 O2
N3
C3
O3

[ Last edited by hao_jian on 2010-6-25 at 15:18 ]
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8楼2010-06-25 15:13:44
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hao_jian

木虫 (正式写手)
triiawypm(金币+5):哈哈,谢谢你啊.我的意思并不是想两个SAME配套使用.只是想问问SAME是单独使用还是配套使用. 2010-06-25 17:20:46
1楼那个网址，ga-03.res文件中，有个例子：
same ga2 c14 c15b
GA2   5    0.445618    0.809818    0.031361    11.00000    0.01795
C14   1    0.423036    0.664284   -0.020920    11.00000    0.03428
C15A  1    0.371714    0.592399   -0.007072    31.00000    0.04645
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9楼2010-06-25 15:27:51
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hao_jian

木虫 (正式写手)
帝夫:感谢回帖交流！ 2010-06-26 09:14:33
不知道这样还会不明白？
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10楼2010-06-25 15:29:09
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