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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 【求助】shelx，还是一个有关加氢的问题
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】shelx，还是一个有关加氢的问题 已有4人参与

初学乍练，对shelx应用不是很熟练，请大家来帮忙。
我现在要对一个NH3上的N加氢，但是这个NH3是在配合物外界的，就是说不和中心原子成键。我用HFIX理论加氢，结果提示说not bonded for suitable atome for AFIX，是不是就是说氢原子取向是不固定的，也就无法确定其坐标？如果我现在知道这个N原子和其他配体上的H原子有氢键，那么是不是就能确定这个N上的H的坐标了？谁知道具体怎么做吗？十分感谢！！
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1楼 2010-06-16 18:58:39
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ren1128

禁虫 (正式写手)
★ ★
rain841230(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-06-18 14:03:17
本帖内容被屏蔽
5楼2010-06-18 12:49:24
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
rain841230(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-06-17 13:12:49
首先明确是要理论加氢，还是Q峰加氢。
如果是理论加，就要明确N的杂化方式，即氮的成键模式。
SHELXTL的菜单中有理论加氢的各种方式，选好就可以了。
赞一下(2人) 回复此楼
▄︻┻┳═一................................................
2楼2010-06-17 11:43:28
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

Alchemist
★ ★
rain841230(金币+1):谢谢参与
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-06-17 13:13:12
我只知道理论加氢，好像O原子的氢加不了，楼上高手多说点呗。

[ Last edited by yunruirui on 2010-6-17 at 12:56 ]
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-06-17 12:53:51
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by etongtong at 2010-06-17 04:43:28:
首先明确是要理论加氢，还是Q峰加氢。
如果是理论加，就要明确N的杂化方式，即氮的成键模式。
SHELXTL的菜单中有理论加氢的各种方式，选好就可以了。

我已经看过Q峰了，没有找到可能存在H的峰，所以只能用理论加氢。我用的HFIX 33，就是和甲基一样的加氢方式。但似乎不行，因为-CH3是和碳链有成键的，而NH3的旋转自由度更大，无法计算周围H的位置，所以想通过其他H对N的氢键的取向性来限制自由度，但是不知道应该怎么操作。
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4楼2010-06-17 19:34:22
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