| 查看: 916 | 回复: 2 | |||
[交流]
【求助/交流】求助，求助同源性计算 已有2人参与
|
| 求助。各位高人，您们好。 虾米有个问题跪求大家帮助。 我分离到的几十个不同属的菌。测了its序列。 在计算同源性的时候出了问题。 问题是，如果把几十个菌核他们的相似序列放在一起共同计算的话，例如1号菌和它对于的菌的同源性为97.6%，98.7%。如果就是单独拿着三个菌计算同源性的话，同源性结果又不一样，有变化，那么我到底是用全部菌来一起算的数据，还是用单独三个菌算的数据？ 以那个为准则？ 谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
材料调剂
已经有4人回复
-
面上模板改不了页边距吧？
已经有6人回复
-
307求调剂
已经有6人回复
-
304求调剂
已经有5人回复
-
317一志愿华南理工电气工程求调剂
已经有8人回复
-
272求调剂
已经有3人回复
-
化工专硕348，一志愿985求调剂
已经有6人回复
-
292求调剂
已经有3人回复
-
290求调剂
已经有6人回复
-
295求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 【求助/交流】请问如何用NCBI进行进化树和同源性比较？
已经有7人回复
- 【求助/交流】blast 怎么做带boxshade的基因同源性比较（有图）？
已经有7人回复
- 【求助/交流】pCR引物设计的详细规则
已经有7人回复
- 【求助】求助如何计算坛子的体积
已经有18人回复
- 【求助】国内做蛋白质核磁共振和X晶体衍射的单位
已经有5人回复
- 【求助/交流】荧光原位杂交实验技术
已经有13人回复
- 【求助/交流】人的同源性
已经有14人回复
- 【求助/交流】关于PCR的问题
已经有18人回复
- 【求助/交流】Real time RT-PCR 引物设计问题（高悬赏请高手帮忙）
已经有28人回复
2楼2010-06-09 00:41:04
reasonspare
木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.894
- 金币: 2262.1
- 红花: 11
- 帖子: 1908
- 在线: 72.5小时
- 虫号: 180928
- 注册: 2006-02-10
- 专业: All in one
★ ★
1949stone(金币+2):够细致 2010-06-09 11:43:26
1949stone(金币+2):够细致 2010-06-09 11:43:26
|
你这个问题很常见，这也就是所说，你对这些菌的背景了解多少，有没有已知进化的报道，进而通过引入标准菌株进行同源性分析。也就是你需要参照物。 在同源性分析中如果没有参比菌株的话，通俗的讲如果所有的菌株有相同的机会的话（各为独立个体，作为参照物与其他相比），其结果会相差很远，但是如果认为地拿某一个与其他的相比，这样又缺乏科学性（为什么不拿其他的？）／ 当然，在没有参考物，你也能得到一个同源性，但是这同源性的相对（没有进化意义上的方向性：父－〉子，还是子－〉父，而是说明两者的多大的不同或相似） |
3楼2010-06-09 06:21:39
