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cnmaomao

至尊木虫 (著名写手)

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[交流] 【求助】什么才是做体液生物标志物最好的蛋白质组学技术?已有3人参与

现在已经有很多可以用来找生物标志物的蛋白质组学技术,但就体液来说,比如血液,什么才是最有效的技术呢? 是2DE-MS, 还是iTRAQ, label free? 如何才能提高找到的生物标志物验证的成功率呢?

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1楼2010-06-08 13:36:18

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茯苓素

铜虫 (小有名气)

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★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

这个没有绝对吧，2DE-MS，对疏水性蛋白，分子量较大的蛋白，和极酸和极碱的蛋白不合适，而抛开gel,所谓的“shotgun”技术，对色谱的要求较高。
而且，对于血液来说，怎么把高丰度蛋白去掉，而不影响其余低丰度蛋白也是个问题。
另外，如果标记物是小分子，可能极性太大，反而用GC-MS比LC-MS更适合，总之，没有绝对最好的。
P.S iTQAQ和labe free是用来做定量的，前者用同位素标记，而且一般只能用AB的质谱效果也许比较好，后者一般用数理统计的方法。

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3楼2011-06-05 20:44:14

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