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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】优化散射区和中间区域的原子
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zhangying09

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化散射区和中间区域的原子 已有4人参与

各位前辈，我想问一下在ATK里怎么优化散射区和中间区域的原子，让他们之间的接触距离更加合理
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1楼 2010-06-01 22:18:51
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youngjfly

银虫 (初入文坛)
★ ★ ★
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aylayl08(金币+2):谢谢指点 2010-09-29 19:05:14
引用回帖:
Originally posted by zhangying09 at 2010-06-02 16:48:41:



做很多点什么意思啊，是不是一步步改变散射区和中间区域的距离，但是最优点的判据是什么呢？？？还有这事我做的优化文件贴出来大家看看

from ATK.TwoProbe import *
import ATK
ATK.setVerbosityLevel ...

因为优化好中心分子了，所以ATK的自动优化有可能会破坏你以前的结构，教程里面的两个H原子就跑偏了。所以还是手动调节距离比较稳妥，只要计算total energy，取最小的能量就行。本人愚见
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真的很想把你搞好。
10楼2010-09-29 16:26:19
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kaypu

铁杆木虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
上次我也问这个问题了，没有回复的 同求这个问题 我就是里面的几何限制不知道该如何设置
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2楼2010-06-02 07:38:39
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
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zzy870720z(金币+2):多谢专家指导 2010-06-02 08:25:27
还没有一个非常合适的方法。

本人曾在此版回答过类似的问题。

另一种方法，将它转换为equlivalent bulk system of a two-probe system，然后采用只有优化c轴的方法来优化结构。
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3楼2010-06-02 08:24:25
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zhangying09

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-02 08:24:25:
还没有一个非常合适的方法。

本人曾在此版回答过类似的问题。

另一种方法，将它转换为equlivalent bulk system of a two-probe system，然后采用只有优化c轴的方法来优化结构。

那怎样在转化到TWO—prob电极系统呢？？
还有就是看一篇文章上是用material studio 优化的，我想问一下版主可知道怎么优化呢
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4楼2010-06-02 09:02:52
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