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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 【求助】吸附能结果比较！
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B.C.Wang

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】吸附能结果比较！ 已有5人参与

我计算的材料两个表面的算法有些不同，其中一个表面应用dipole correction， 另外一个则没有用，其他参数一样，这时候得到吸附能可以比较吗？
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1楼 2010-05-31 19:42:01
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随心意

新虫 (小有名气)
★ ★
gavinliu7390(金币+2):谢谢交流！ 2010-06-01 10:51:47
你好，我也在做表面，能帮我看看这个问题吗
如果用castep单计算单个氧原子的energy，把它放入10*10的晶胞中，不勾选optimize cell ，k点选1*1*1，都是按照说明来做的，可是优化总是失败是怎么回事呢
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2楼2010-05-31 19:48:21
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B.C.Wang

金虫 (小有名气)
你把氧原子放在原点的位置试试，Task不用选Geometry Optimize,直接算能量就行了！
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3楼2010-05-31 21:30:46
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
B.C.Wang(金币+2): 2010-06-01 08:35:58
gavinliu7390(金币+3):谢谢交流！ 2010-06-01 10:51:53
引用回帖:
Originally posted by B.C.Wang at 2010-05-31 19:42:01:
我计算的材料两个表面的算法有些不同，其中一个表面应用dipole correction， 另外一个则没有用，其他参数一样，这时候得到吸附能可以比较吗？

clean surface (没有吸附的表面), 没有做dipole correction。实际上这部分是否要做dipole correction，取决于表面slab是怎么取的，还与体系的具体性质（如果是金属，或者表面的第一层就是成剂量比的,就没有必要做dipole correction;还有取的双表面的slab，上下表面具有镜像对称性或反演对称性，没有必要做dipole correction）
surface with adsorbate(有吸附物的表面)做了dipole correction。

这样体系的吸附能就是两个体系的总能之差。
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4楼2010-06-01 08:27:00
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B.C.Wang

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-01 08:27:00:


clean surface (没有吸附的表面), 没有做dipole correction。实际上这部分是否要做dipole correction，取决于表面slab是怎么取的，还与体系的具体性质（如果是金属，或者表面的第一层就是成剂量比的,就没有必 ...

我可不可以这样理解：surface with adsorbate（吸附物是极性分子） 需要做dipole correction，而clean surface看情况定是否需要做dipole correction。我的情况是我计算了两个表面的吸附：one of  clean surface具有垂直表面的dipole moment，the other没有，那么the surface with dipole moment should add a dipole correction，这两个表面的水吸附都应该做dipole correction。谢谢！
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5楼2010-06-01 16:13:33
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liang7035

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-01 08:27:00:


clean surface (没有吸附的表面), 没有做dipole correction。实际上这部分是否要做dipole correction，取决于表面slab是怎么取的，还与体系的具体性质（如果是金属，或者表面的第一层就是成剂量比的,就没有必 ...

我做镍111表面6层的氧原子的F位吸附，都算一个星期了，还没出结果，setup -task-Geometry optimization 这个这么选吧，optimize cell 不勾选吧，参数得这样设置吧，请高手指点啊！
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一个一心向上的人整个世界都会给他让路！
6楼2010-06-01 17:15:16
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
xiaohunhun(金币+2):xiexie 2010-06-01 23:04:07
需要仔细看输入文件里面的具体设置。如果你没有选择geometry optimization，那一般默认的是做静态的计算。如果静态的计算了一周都没有结束，那可能就是你的输入文件哪里不合适了。
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7楼2010-06-01 19:27:47
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liang7035

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by valenhou001 at 2010-06-01 19:27:47:
需要仔细看输入文件里面的具体设置。如果你没有选择geometry optimization，那一般默认的是做静态的计算。如果静态的计算了一周都没有结束，那可能就是你的输入文件哪里不合适了。

我选择了，geometry optimization，而且计算时曲线描绘的都很合理，就算计算的慢，不是不计算，每天都计算1-2次，我认为可能是因为计算机的配置不够，处理6层的晶胞，很吃力，所以计算缓慢。。。不知道分析的是否正确啊！
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8楼2010-06-02 09:45:57
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随心意

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by B.C.Wang at 2010-05-31 21:30:46:
你把氧原子放在原点的位置试试，Task不用选Geometry Optimize,直接算能量就行了！

这样做了，还是失败呢，失败提示为
warning:Max SCFcycles performed but system has not reched the groundstate
warning：electronic minimisation did not coverge when finding ground state
error check-elec-ground-state electronic-minimisation of inital cell failed
不知道是怎么回事呢
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9楼2010-06-02 10:00:45
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B.C.Wang

金虫 (小有名气)
你要得到单个氧原子的能量是吧，试试这样算可不可以，优化O2分子，然后把得到的能量除以2.
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10楼2010-06-02 11:01:51
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