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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】优化过程中结构中的两个原子为什么越跑越近，直至相接
汕头大学海洋科学接受调剂
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victoria7850

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】优化过程中结构中的两个原子为什么越跑越近，直至相接 已有11人参与

RT。
大分子结构，优化过程中，O和H越跑越近，直至相接。这样对整个结构有没有什么影响？
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1楼 2010-05-23 14:48:40
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mengfc

金虫 (正式写手)
★
aylayl08(金币+1): 2010-05-24 08:04:25
相接?计算有问题吧？
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2楼2010-05-23 15:04:43
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子
★
aylayl08(金币+1): 2010-05-24 08:04:20
貌似不大可能。
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愿好运与快乐伴随你！
3楼2010-05-23 15:20:44
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vigaryang

木虫 (正式写手)
★
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-05-24 08:04:14
相接？顶多相互靠近而形成氢键吧？
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4楼2010-05-23 15:55:13
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sunhaitao

木虫 (小有名气)
★
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-05-24 08:04:05
会不会是你的初始构型有问题！检查看看
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一点一点进步！
5楼2010-05-23 18:34:14
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qianyang

铁杆木虫 (小有名气)
★ ★ ★
aylayl08(金币+3):谢谢讨论 2010-05-24 08:03:39
Gaussian计算本来就没有键的概念，只有电子原子核所在坐标根据一系列方程的计算来得到你所要的结果，如果一味的要强调化学键的，只有通过像AIM或则NBO去分析。你的东西是大分子结构的，其实不适合用高斯计算，有太多的不确定因素了，建议LZ还是用其他分子力学软件比较好吧，像MS之类的都是很好的分子模拟软件。
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6楼2010-05-23 19:25:56
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fooo

金虫 (正式写手)
★ ★
aylayl08(金币+2):谢谢讨论 2010-05-24 08:03:49
大分子结构究竟多大？gaussian一般算不了大分子，得用mm方法了。再说，大分子的构型多如牛毛，你的初始构型很可能有问题。
引用回帖:
Originally posted by victoria7850 at 2010-05-23 14:48:40:
RT。
大分子结构，优化过程中，O和H越跑越近，直至相接。这样对整个结构有没有什么影响？

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7楼2010-05-23 19:29:33
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★ ★
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-05-24 08:03:57
aylayl08(金币+2):后边证明老兄说着了，加奖励 2010-05-27 18:22:45
莫非楼主有些元素没有指认基组？
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前途光明，出路难觅！
8楼2010-05-23 21:04:10
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victoria7850

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-05-23 21:04:10:
莫非楼主有些元素没有指认基组？

所有的元素都有指认基组，只是在作业中看到它说有些元素没有指认基组。可是明明已经指认了的嘛
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9楼2010-05-24 09:01:45
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victoria7850

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fooo at 2010-05-23 19:29:33:
大分子结构究竟多大？gaussian一般算不了大分子，得用mm方法了。再说，大分子的构型多如牛毛，你的初始构型很可能有问题。


也不是很大，也就500个基函数
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10楼2010-05-24 09:02:10
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