应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】有没有做土壤微生物群落多样性的 可以进来交流一下
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
161/2返回列表12下一页
查看: 2900  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】有没有做土壤微生物群落多样性的 可以进来交流一下 已有10人参与

RT土壤中微生物多样性，
用细菌 或者真菌 16s RNA基因通用引物做PCR之后做多样性分析
在PCR这步试验中，从土壤中提取基因组后作PCR,真菌很容易能P出来 但是细菌却很难  往往条带弥散~~如图


1 如果说 震荡剧烈使得基因组破碎，但是在做真菌PCR的时候 一半是用涡旋振荡仪混匀的 但是也能够P出来 而且很亮
2 如果说 模板量多少，这个我已经做了很多 梯度，不稀释，稀释10倍 稀释50倍，100倍都做了
3 如果说引物不对，用的是 通用引物，而且合成的公司也是做生物很专业的 公司
4 退火温度，这个不好说 我觉得退货温度上下差几度 就算效果不好 也不可能一点都没有
5 PCR 仪器，两台 bio-rad 都用了 结果还是那样
6 杂质的问题，从纯细菌中提取的基因组 杂质蛋白很多 如图
但是P出来时这样

就这么多了 各位帮忙分析一下吧 ！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-05-21 16:23:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
怎么没有人来帮忙解析一下呢 ？
赞一下 回复此楼
2楼2010-05-21 21:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
哎 继续求助啊
回复此楼
3楼2010-05-21 21:26:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
帮忙啊 还没有解决 做了快一个月了
赞一下 回复此楼
4楼2010-05-26 19:53:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tdong06

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
退火温度。多设几个提度试下。。。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-05-26 20:30:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
先把退火温度设低吧
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
6楼2010-05-27 13:14:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木木人

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
我也打算做微生物多样性 用DGGE方法 请问你用的通用引物是什么 能分享一下吗？ 谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2012-02-14 15:18:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

沁荃

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
确实是这样的，PCR条带很弥散，原来我也试过不同退火温度，效果也不好~可能是通用引物的匹配性不好吧~有文献是这么说的~你用的通用引物是27f和1492r吗？
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-07 22:48:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
1264204楼: Originally posted by 木木人 at 2012-02-14 15:18:45:
我也打算做微生物多样性 用DGGE方法 请问你用的通用引物是什么 能分享一下吗？ 谢谢

16s V3  经典的引物   341F  518R
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-08 01:30:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木子勇夏

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by 老夏853 at 2012-04-08 01:30:22
16s V3  经典的引物   341F  518R...

这个很好P的啊，细菌真菌的都能P出来，但是真菌的DGGE条件我做的不好，跑的胶不好看
赞一下 回复此楼
10楼2013-04-11 09:15:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 老夏853 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-24 6/300 2026-03-29 20:45 by 无际的草原
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-29 20:21 by dophin1985
[考研] 化学0703 调剂 306分 一志愿211 +7 26要上岸 2026-03-28 7/350 2026-03-29 20:04 by 无际的草原
[考研] 348求调剂 +5 小懒虫不懒了 2026-03-28 5/250 2026-03-29 10:34 by 唐沐儿
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +4 IceGuo 2026-03-26 5/250 2026-03-29 01:25 by griffith2014
[考研] 0703化学调剂，求导师收 +9 天天好运来上岸� 2026-03-24 10/500 2026-03-28 22:17 by chemzp
[考研] 生物学学硕，一志愿湖南大学，初试成绩338 +6 YYYYYNNNNN 2026-03-26 7/350 2026-03-28 20:52 by 唐沐儿
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +15 荷包蛋hyj 2026-03-26 15/750 2026-03-28 04:13 by fmesaito
[考研] 330一志愿中国海洋大学 化学工程 085602 有读博意愿 求调剂 +3 wywy.. 2026-03-27 4/200 2026-03-28 03:32 by fmesaito
[考研] 316求调剂 +5 Pigcasso 2026-03-24 5/250 2026-03-27 12:10 by zhshch
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
[考研] 调剂推荐 +5 清酒714 2026-03-26 6/300 2026-03-27 11:12 by 不吃魚的貓
[考研] 359求调剂 +4 王了个楠 2026-03-25 4/200 2026-03-27 08:43 by 不吃魚的貓
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭