24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Hansongtao

捐助贵宾 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 57
散金: 7
帖子: 63
在线: 6.6小时
虫号: 615363
注册: 2008-10-01

[交流] 【求助】我的这个内坐标怎么没有原子序数已有5人参与

我用gaussian view作了一个葡萄糖结构优化的输入文件，如下所示，但现在有个问题就是：起头的原子后面怎么没有它自己的原子序数？

%chk=D:\Doctor_Paper\Calculation3\PUTaoTang\hao\NeiZuoBiao\PUTaoTang_WanZ#1.chk
# opt freq uam1

[No Title]

0 1
C
C                1 1.51467361
C                2 1.50968158 1  108.09858957
C                3 1.50734883 2  110.94672563 1  -55.24627985 0
O                4 1.40935927 3  112.96355202 2 52.08462205 0
C                5 1.40671180 4  115.11851762 3  -52.62410955 0
O                4 1.41532189 3  113.82806620 2  -64.44600475 0
H                4 1.11326503 3  111.49599356 2  174.01131481 0
H                3 1.11585545 2  109.69264085 1 65.44225427 0
O                3 1.40619604 2  109.06768063 1 -178.24510452 0
O                2 1.40496164 1  109.70431946 6  177.58301099 0
H                2 1.11381530 1  111.08475700 6  -64.22755056 0
O                1 1.40699940 2  107.52914375 11  -61.58508828 0
H                1 1.11408471 13  107.05215576 2 -119.49911850 0
C                6 1.52426162 5  107.99607566 4  178.37837226 0
H                6 1.11613663 5  109.12119698 4  -64.74218189 0
O                15 1.41466332 6  109.74808945 5 67.07052848 0
H                7 0.96113530 4  107.09443123 3  159.30081366 0
H                10 0.96168953 3  107.76230744 2  -49.14667620 0
H                11 0.96085446 2  108.03719779 1 61.18026192 0
H                13 0.95918631 1  110.44647078 2  161.59992660 0
H                15 1.11251241 6  111.88143655 5 -174.67520698 0
H                15 1.11249267 6  111.75664245 5  -52.41285677 0
H                17 0.96000678 15  109.83138166 6 -174.14093989 0

[ Last edited by Hansongtao on 2010-5-20 at 09:23 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

1楼 2010-05-20 09:21:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

LuPeng5366

新虫 (著名写手)

牛牛

应助: 1 (幼儿园)
金币: 0.5
散金: 1512
红花: 3
帖子: 1562
在线: 234.2小时
虫号: 738149
注册: 2009-04-02
性别: GG
专业: 原子和分子物理

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

引用回帖:

Originally posted by 375642546 at 2010-05-20 11:59:29:

你的内坐标输入没有问题
C（1）
C（2）          1 1.51467361
C（3）          2 1.50968158 1  108.09858957
C（4）          3 1.50734883 2  110.94672563 1  ...

楼上正确

回复此楼

自信，坚强，勇敢。

6楼2010-05-21 09:40:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 6 个回答

kekemi_1127

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 6485.2
散金: 390
红花: 1
帖子: 1069
在线: 176.6小时
虫号: 900597
注册: 2009-11-11
性别: MM
专业: 原子和分子物理

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流

我做的都没显啊，应该没的问题的

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2010-05-20 11:22:42

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

375642546

木虫 (正式写手)

应助: 9 (幼儿园)
贵宾: 1.017
金币: 3406.8
散金: 329
红花: 26
沙发: 1
帖子: 840
在线: 575.8小时
虫号: 800816
注册: 2009-06-29
专业: 理论和计算化学

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
aylayl08(金币+5):辛苦了，谢谢详细解释 2010-05-20 15:36:49

引用回帖:

Originally posted by Hansongtao at 2010-05-20 09:21:43:
我用gaussian view作了一个葡萄糖结构优化的输入文件，如下所示，但现在有个问题就是：起头的原子后面怎么没有它自己的原子序数？

%chk=D:\Doctor_Paper\Calculation3\PUTaoTang\hao\NeiZuoBiao\PUTaoTang_Wan ...

你的内坐标输入没有问题
C（1）
C（2）          1 1.51467361
C（3）          2 1.50968158 1  108.09858957
C（4）          3 1.50734883 2  110.94672563 1  -55.24627985 0
以下对一些输入的做浅显的解释。为了方便说明，我对原子进行了标号。单位省去不说了。
先解释第二行：2号C与1号C间的距离约为1.5146。
第三行：3号C于2号C间的距离约为1.5097，3号C，2号C，1号C间的夹角约为108.10.
第四行：4号C与3号C间的距离为1.5073，4号C,3号C,2号C间的夹角约为110.95.4号C,3号C,2号C，与1号C间的二面角约为-55.24. 0表示该原子的位置不被冻结。

请高手指点。