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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助】dl_poly 如何固定键角
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043114076

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dl_poly 如何固定键角 已有3人参与

比如A-B-C三个原子，我想固定键角，尝试将AB键长和AC键长固定来达到目的，结果报错：
DL_POLY terminated due to error   105
error - shake algorithm failed to converge
不知有没有其他方法来有效的固定键角？
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1楼 2010-05-19 09:56:10
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2):谢谢 2010-05-19 11:36:51
也许，需要把三个原子弄成一个rigid body，但又怕和别的设置相矛盾。
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2楼2010-05-19 11:19:31
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢你把解决方案放上来，如果自己解决了，发上来给大家分享，这种方式很好。 2010-05-19 19:58:01
基本上已经解决了。我使用了两种方法
1.定义A-B-C角度，设置力常数足够的大。这样角度变化就可以忽略。但必须把时间步设短，否则也会报错。原因是力常数大了，振动频率也会增大。
2.其实控制AB和AC键长（AC之间距离）也是可以的，把时间步设定足够小就行。然后逐渐改大。
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3楼2010-05-19 18:02:14
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hongyesies

金虫 (正式写手)

红叶
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-06-01 16:04:12
dlpoly FILED里可以用RIGID和constraints来达到这个目的。
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4楼2010-06-01 15:30:05
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043114076

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-01 20:26:10
引用回帖:
Originally posted by hongyesies at 2010-06-01 15:30:05:
dlpoly FILED里可以用RIGID和constraints来达到这个目的。

rigid不行，因为我还有二面角
constraints只能固定键长吧？
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5楼2010-06-01 18:36:10
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hongyesies

金虫 (正式写手)

红叶
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-06-02 10:00:49
你的是A-B-C三个原子，用constraints固定了键长，不就把键角也固定了吗。dlpoly2.0  example 18--19 计算水分子  H-O-H 就是用的 constraints来固定。
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6楼2010-06-02 09:30:31
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