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guosy1999木虫 (正式写手)
中纪委反2协会督导员
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【求助】对RDF的理解及其分析步骤 已有3人参与
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有几个问题请各位指教一下： 1。径向分布函数(Radial distribution function) 与对分布函数(pair distribution function)的区别与联系。。各自的用途。 看到过关于两者分析的文献，具体看不出有太大的意义区别 2。在MS的Discover模块-Analysis工具中该如何分析RDF或PDF 该对跑完MD的轨迹文件.xtd做分析吗？做分析前还需要做哪些设置，如edit sets等 还有别的那些需要注意的，等。（我做的是小分子在分子筛中的扩散） 请高手介绍一下具体的分析步骤。 一点BB聊表谢意！  [ Last edited by guosy1999 on 2010-5-13 at 17:27 ] |
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guosy1999(金币+10):3Q 2010-05-17 09:00:19
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应该是选择原子种类来设置set，pdf是一个统计概念，所以无所谓中心原子。 g(OH)的计算方法是分别设置set O和Set H，然后分析，分析时需要勾选intra 附Set设置的两种方法，二者不同之处在与set中原子的选择 其一，直接选择原子； 其二，edit>Atom selection对话框，在select by property下拉选项里设置element，在下面选择is，后面选需要设置的元素，然后点最下面的select。 最后，edit>Edit Sets，在对话框中点New，设置name，OK。 Sets设置完之后，在Forcite/Discover模块用Analysis来分析即可。 |
4楼2010-05-14 09:51:35