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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】Material Studio中氢键计算的问题
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siga5609

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Material Studio中氢键计算的问题 已有12人参与

各位仁兄……我最近想用Material Studio做一个考察体系氢键键能变化的模拟，设置了氢键的监视器，但是不管我采用COMPASS力场还是Dreiding力场，结果hydrogen bond的能量都是0.0000。这是为什么呢？是Material Studio的本身问题么？
应该怎么解决呢？
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愚蠢的地球人，受死吧！哇哈哈哈……
1楼 2010-05-10 21:12:56
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qasd

木虫 (著名写手)
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aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-07-04 09:12:23
compass不考虑这个，drieiding也是0？
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2楼2010-05-10 23:17:20
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siga5609

木虫 (小有名气)
怒了……卸了……重装了，drieiding的确可以算出了。compass还是不行，我怎么记得compass是考虑了氢键的，是不是它把氢键作用归到其它非键作用里了？
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愚蠢的地球人，受死吧！哇哈哈哈……
3楼2010-05-11 00:20:27
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cf666

新虫 (小有名气)
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引用回帖:
Originally posted by siga5609 at 2010-05-11 00:20:27:
怒了……卸了……重装了，drieiding的确可以算出了。compass还是不行，我怎么记得compass是考虑了氢键的，是不是它把氢键作用归到其它非键作用里了？

请问drieiding在哪里选取？我怎么没有见到过drieiding。在materials  studio 软件涉及力场中氢键的研究这篇文献中看到 compass 是比较合理的力场。不知道你最后做出来了没有？期待回复。
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4楼2010-07-03 16:57:05
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jijun7308

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aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-08-01 18:26:00
COMPASS考虑了氢键,好象是在non-bond里面。
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5楼2010-07-12 10:10:41
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sophia_999

金虫 (小有名气)
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最近也在研究与氢键有关的问题，一起学习一下。

另外，MS里"calculate hydrogen bond"除了能显示出可能的氢键以外，还有什么功能呢？
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6楼2010-08-01 14:18:44
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qasd

木虫 (著名写手)
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aylayl08(金币+1):谢谢提示 2010-08-01 18:27:07
compass力场里面没有氢键项，计算氢键要自己编程统计
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7楼2010-08-01 15:38:17
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jijun7308

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zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-08-10 19:09:54
compass 力场里面没有单独的氢键项，但compass力场的non-bond考虑了氢键的作用
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8楼2010-08-10 17:21:04
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jijun7308

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我错了

★
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我错了,我看了一下资料,Compass没有单独的 h bond项,只有Drieding有.
但是我记得有文献利用Compass计算氢键的.
不管怎么说,我还是错了,应该认真看看资料再发言.谢谢qasd指出.
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9楼2010-08-11 14:07:21
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huangshuang1

木虫 (著名写手)
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引用回帖:
1190534楼: Originally posted by qasd at 2010-08-01 15:38:17
compass力场里面没有氢键项，计算氢键要自己编程统计

请问下，我用想统计氢键，是先通过calculate hydrogen bond计算，通过什么编程统计啊？还有drieiding在哪里选取？
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10楼2012-09-18 09:57:10
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