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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 关于氢键生命周期的计算
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胡立梅

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于氢键生命周期的计算

各位大侠，请问有没有用Gromacs计算氢键周期的？哪个命令呢？我用g_hbond计算的氢键数，咋能知道它的生命周期呢？
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1楼 2013-08-27 10:24:19
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以根据氢键成键自关联函数算出来
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2楼2013-08-27 12:34:22
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胡立梅

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-08-27 12:34:22
可以根据氢键成键自关联函数算出来

知道自相关函数后怎么求得氢键寿命的呢？是积分吗？但是不知道自相关函数的函数怎么求出来呢？谢啦~
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3楼2013-08-27 15:47:26
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sciencejoy

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
dbb627: 金币+1, 谢谢指导 2013-08-27 19:56:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 胡立梅 at 2013-08-27 15:47:26
知道自相关函数后怎么求得氢键寿命的呢？是积分吗？但是不知道自相关函数的函数怎么求出来呢？谢啦~...

自相关函数取对数，斜率就是氢键寿命。
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4楼2013-08-27 15:55:02
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胡立梅

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-08-27 15:55:02
自相关函数取对数，斜率就是氢键寿命。...

哦，我试试，谢啦~
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5楼2013-08-28 09:46:46
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好好学习444

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sciencejoy at 2013-08-27 15:55:02
自相关函数取对数，斜率就是氢键寿命。...

你好，大神，能解释一下氢键自相关函数取对数，斜率就是氢键寿命。gromacs手册是氢键寿命对自相关函数对时间间距求积分。对你的氢键自相关函数取对数，斜率就是氢键寿命  有点不理解？谢谢了。
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说好努力的
6楼2015-06-13 10:11:00
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