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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 【求助】ATK并行的问题
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gradius

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】ATK并行的问题 已有6人参与

这两天终于等来了ATK-2008的license，装好后$atk --version显示为ATK 2008.10.0 Linux-x86_64 build 14677 2008-11-27，说明安装成功。交作业写了一个简单的脚本，内容为mpirun -np 4 ~/soft/atk-2008.10.0/bin/atk water02-egv.py > water.log，运行的时候top一下发现还是单个cpu在跑而不是四个，应该怎样解决这个问题？我用的mpirun是mpich1.2.7
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请广大老师同学批评指正！
1楼 2010-05-10 08:58:42
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wuli8(金币+1): 2010-05-23 11:00:42
引用回帖:
Originally posted by zhangguangping at 2010-05-22 05:21:08:

用mpd启动atk什么意思？ 安装好了mpich2之后，直接mpd&启动起mpich不就可以用mpirun -np 8 atk *.py &并行吗？
但是我的也不能并行啊！虽然是有那么多核在跑。但是屏幕上输出一些很奇怪的信息。
Sepa ...

这个问题解决了，并行的时候使用这样命令就行了：
mpirun -np 8 atk *.py >out < /dev/null &就可以了。输出文件里面就没有那些乱七八糟的东西了。
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弘德明志博学笃行
7楼2010-05-22 13:35:15
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忽悠小皮

铜虫 (小有名气)
手册上有介绍，仔细看过没有？
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2楼2010-05-19 21:34:56
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
★
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引用回帖:
Originally posted by gradius at 2010-05-10 01:58:42:
这两天终于等来了ATK-2008的license，装好后$atk --version显示为ATK 2008.10.0 Linux-x86_64 build 14677 2008-11-27，说明安装成功。交作业写了一个简单的脚本，内容为mpirun -np 4 ~/soft/atk-2008.10.0/bin/a ...

你的lic是申请的免费的？
哎，我想用个破解的。免费的需要该机器的时间，很不方便啊。另外你申请的时候还要提供机器码是吗？也就是说你的lic只能用与一台机器。
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弘德明志博学笃行
3楼2010-05-20 09:44:46
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163.com

金虫 (著名写手)

实习版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
这个做并行的时候友好多东西，我们组做这歌ATK 的并行也是搞了好久

最起码的， 你的mpi装好了没有？ 用mpd启动ATK
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lisi2007
阿什顿联
4楼2010-05-21 11:51:11
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