| 查看: 1506 | 回复: 13 | |||
meimeinn银虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】并行计算问题 已有5人参与
|
|
在服务器上计算的时候，有时CPU利用率非常低，都在10%以下，输出文件可以看到一个关于K点并行计算的警告（如下），但是去帮助里看了半天也不知道怎么改，哪位帮帮忙，谢谢了。 nkpt*nsppol is not a multiple of nproc_kpt The k-point parallelisation is not efficient. invars1: mkmem undefined in the input file. Use default mkmem = nkpt invars1: With nkpt_me= 2 and mkmem = 10, ground state wf handled in core. Resetting mkmem to nkpt_me to save memory space. |
回复此楼» 猜你喜欢
自荐读博
已经有5人回复
-
求个博导看看
已经有16人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
-
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有5人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
需要合成515-64-0，50g，能接单的留言
已经有4人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有10人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- 请问MS-linux-cluster安装之后无法并行的问题？
已经有5人回复
- gaussian 03Revison-E01版在Window 下不能并行计算啊!
已经有9人回复
- 【求助完结】Linux系统下MS5.5的并行计算调度问题
已经有12人回复
- 【求助】ms5.5单机多核并行问题
已经有9人回复
- 【求助】单机多核UDF怎么并行计算
已经有15人回复
- 【求助】关于服务器多节点并行利用效率问题
已经有10人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
- 【求助】castep并行计算问题
已经有15人回复
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 1ST强帖: 3
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2010-05-07 17:45:04
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
3楼2010-05-07 18:16:45
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 1ST强帖: 3
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
4楼2010-05-07 20:16:21
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
5楼2010-05-07 20:29:35
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
6楼2010-05-07 21:49:33
fzx2008
荣誉版主 (著名写手)
- 1ST强帖: 9
- 应助: 272 (大学生)
- 贵宾: 1.045
- 金币: 21814.1
- 散金: 710
- 红花: 33
- 沙发: 1
- 帖子: 1808
- 在线: 1601小时
- 虫号: 621341
- 注册: 2008-10-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 第一性原理
7楼2010-05-07 21:57:49
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
8楼2010-05-07 22:04:48
casjxm
铜虫 (正式写手)
- 应助: 19 (小学生)
- 金币: 737.1
- 散金: 20
- 帖子: 443
- 在线: 356.1小时
- 虫号: 445122
- 注册: 2007-10-27
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):感谢说明 2010-05-19 08:05:49
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):感谢说明 2010-05-19 08:05:49
|
cpu用不起来，说明并行变量没有设置好，100个cpu如果没设置好，10个cpu都不如。 最好按照网上说明做http://www.abinit.org/documentat ... riables/varpar.html （具体看最后一段） 先设置paral_kgb=-n（n为可用的最大核数）运行后，再根据log中的提示设置npkpt, npband, npfft, bandpp。 If paral_kgb=-n , ABINIT will test automatically if all the processor numbers between 2 and n are convenient for a parallel calculation and print the possible values in the log file. The code will then stop after the printing. This test can be done as well with a sequential as with a parallel version of the code. The user can then choose the adequate number of processor on which he can run his job. He must put again paral_kgb=1 in the input file and launch ABINIT a new time. ABINIT will then find automatically the corresponding values for npband, npfft, npband and bandpp. |
9楼2010-05-18 22:05:06
lzllzl
木虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 2493.8
- 散金: 18
- 红花: 4
- 帖子: 102
- 在线: 393.1小时
- 虫号: 300731
- 注册: 2006-11-26
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
10楼2010-05-18 22:23:11