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meimeinn银虫 (小有名气)
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【求助】并行计算问题 已有5人参与
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在服务器上计算的时候，有时CPU利用率非常低，都在10%以下，输出文件可以看到一个关于K点并行计算的警告（如下），但是去帮助里看了半天也不知道怎么改，哪位帮帮忙，谢谢了。 nkpt*nsppol is not a multiple of nproc_kpt The k-point parallelisation is not efficient. invars1: mkmem undefined in the input file. Use default mkmem = nkpt invars1: With nkpt_me= 2 and mkmem = 10, ground state wf handled in core. Resetting mkmem to nkpt_me to save memory space. |
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cpu用不起来，说明并行变量没有设置好，100个cpu如果没设置好，10个cpu都不如。 最好按照网上说明做http://www.abinit.org/documentat ... riables/varpar.html （具体看最后一段） 先设置paral_kgb=-n（n为可用的最大核数）运行后，再根据log中的提示设置npkpt, npband, npfft, bandpp。 If paral_kgb=-n , ABINIT will test automatically if all the processor numbers between 2 and n are convenient for a parallel calculation and print the possible values in the log file. The code will then stop after the printing. This test can be done as well with a sequential as with a parallel version of the code. The user can then choose the adequate number of processor on which he can run his job. He must put again paral_kgb=1 in the input file and launch ABINIT a new time. ABINIT will then find automatically the corresponding values for npband, npfft, npband and bandpp. |
9楼2010-05-18 22:05:06
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