| 查看: 1606 | 回复: 13 | |||
meimeinn银虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】并行计算问题 已有5人参与
|
|
在服务器上计算的时候，有时CPU利用率非常低，都在10%以下，输出文件可以看到一个关于K点并行计算的警告（如下），但是去帮助里看了半天也不知道怎么改，哪位帮帮忙，谢谢了。 nkpt*nsppol is not a multiple of nproc_kpt The k-point parallelisation is not efficient. invars1: mkmem undefined in the input file. Use default mkmem = nkpt invars1: With nkpt_me= 2 and mkmem = 10, ground state wf handled in core. Resetting mkmem to nkpt_me to save memory space. |
回复此楼» 猜你喜欢
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- 请问MS-linux-cluster安装之后无法并行的问题？
已经有5人回复
- gaussian 03Revison-E01版在Window 下不能并行计算啊!
已经有9人回复
- 【求助完结】Linux系统下MS5.5的并行计算调度问题
已经有12人回复
- 【求助】ms5.5单机多核并行问题
已经有9人回复
- 【求助】单机多核UDF怎么并行计算
已经有15人回复
- 【求助】关于服务器多节点并行利用效率问题
已经有10人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
- 【求助】castep并行计算问题
已经有15人回复
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 1ST强帖: 3
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2010-05-07 17:45:04
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
3楼2010-05-07 18:16:45
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 1ST强帖: 3
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
4楼2010-05-07 20:16:21
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
5楼2010-05-07 20:29:35
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
6楼2010-05-07 21:49:33
fzx2008
荣誉版主 (著名写手)
- 1ST强帖: 9
- 应助: 272 (大学生)
- 贵宾: 1.045
- 金币: 21814.1
- 散金: 710
- 红花: 33
- 沙发: 1
- 帖子: 1808
- 在线: 1601小时
- 虫号: 621341
- 注册: 2008-10-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 第一性原理
7楼2010-05-07 21:57:49
meimeinn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 410.3
- 散金: 263
- 帖子: 125
- 在线: 17小时
- 虫号: 799470
- 注册: 2009-06-26
- 专业: 金属材料表面科学与工程
8楼2010-05-07 22:04:48
casjxm
铜虫 (正式写手)
- 应助: 19 (小学生)
- 金币: 737.1
- 散金: 20
- 帖子: 443
- 在线: 356.1小时
- 虫号: 445122
- 注册: 2007-10-27
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):感谢说明 2010-05-19 08:05:49
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):感谢说明 2010-05-19 08:05:49
|
cpu用不起来，说明并行变量没有设置好，100个cpu如果没设置好，10个cpu都不如。 最好按照网上说明做http://www.abinit.org/documentat ... riables/varpar.html （具体看最后一段） 先设置paral_kgb=-n（n为可用的最大核数）运行后，再根据log中的提示设置npkpt, npband, npfft, bandpp。 If paral_kgb=-n , ABINIT will test automatically if all the processor numbers between 2 and n are convenient for a parallel calculation and print the possible values in the log file. The code will then stop after the printing. This test can be done as well with a sequential as with a parallel version of the code. The user can then choose the adequate number of processor on which he can run his job. He must put again paral_kgb=1 in the input file and launch ABINIT a new time. ABINIT will then find automatically the corresponding values for npband, npfft, npband and bandpp. |
9楼2010-05-18 22:05:06
lzllzl
木虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 2493.8
- 散金: 18
- 红花: 4
- 帖子: 102
- 在线: 393.1小时
- 虫号: 300731
- 注册: 2006-11-26
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
10楼2010-05-18 22:23:11
5