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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】vasp分子动力学模拟求助
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laplacetalor

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp分子动力学模拟求助 已有10人参与

本人之前一直用vasp算电子结构和缺陷，现在领导（外行）提出要做分子动力学模拟，我对此没有任何概念，现在刚开始看基础理论的书，麻烦大家帮帮忙，解答小弟一些问题，尽量浅显，谢谢！
1.MD在理论框架上和第一性原理（赝势平面波，密度泛函理论，周期性边界条件等）有什么区别？
2.MD能用来干嘛？
3.MD和我之前算的缺陷或电子结构（几何优化+静态计算）在方法上有什么区别？
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1楼 2010-05-06 13:09:22
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
★ ★
laplacetalor(金币+10):谢谢！ 2010-05-06 19:20:55
gavinliu7390(金币+2):感谢交流！ 2010-05-06 22:16:06
我来说说,不对的地方请帮提高.
MD与DFT(专指基态能量有关的量,如电子结构,吸附态,过度态等)的区别,在于处理问题的方法和目的.
DFT通过自洽迭代的方法在找到能量最低点,然后分析这一过程中的能量,坐标和电子结构.关注的是静态和平衡态.
MD也会用到DFT来描述原子分子之间的相互作用的,但其特点是让分子,或者原子动起来,在足够长的时间里让结构遍历每一个构象，然后统计时间平均。因而可以计算有限温度下的物理量。
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3楼2010-05-06 18:37:29
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普通回帖

longchang

金虫 (小有名气)
laplacetalor(金币+2):谢谢支持 2010-05-06 18:00:49
顶一下，我老板估计不久也会要求我做分子动力学模拟，欢迎强人出来讲解一下
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2楼2010-05-06 15:46:22
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laplacetalor

银虫 (小有名气)
多谢！那么算同一个材料用MD和DFT哪个内存消耗少，花费时间少，结果更精确，不知道可不可以这样对比？
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4楼2010-05-06 19:35:49
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★
gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-06 22:16:33
laplacetalor(金币+10):谢谢 2010-05-07 11:50:02
参考我在这个帖子的回帖：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2025615

VASP里面的MD方法是基于BOMD的。
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5楼2010-05-06 19:54:19
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)
★
gavinliu7390(金币+1):感谢交流！ 2010-05-06 22:16:46
laplacetalor(金币+4): 2010-05-07 11:51:56
引用回帖:
Originally posted by laplacetalor at 2010-05-06 19:35:49:
多谢！那么算同一个材料用MD和DFT哪个内存消耗少，花费时间少，结果更精确，不知道可不可以这样对比？

VASP里面的MD计算，就是要通过DFT精确计算每个离子步下离子所受的力。做MD的计算要简单的结构优化所要花的资源多。
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6楼2010-05-06 19:57:41
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zhou_2009

金虫 (初入文坛)
能不能给我发个ＶＡＳＰ的安装程序，我想做一些模拟！万分感激！！
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7楼2010-05-06 23:22:57
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
laplacetalor(金币+4): 2010-05-07 11:52:10
引用回帖:
Originally posted by laplacetalor at 2010-05-06 19:35:49:
多谢！那么算同一个材料用MD和DFT哪个内存消耗少，花费时间少，结果更精确，不知道可不可以这样对比？

要马儿跑的好,又要不吃草的事情,很难呢.
计算精度和资源消耗情况需要平衡一下,只要能说明你的研究目的就可以了.
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8楼2010-05-07 08:59:15
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laplacetalor

银虫 (小有名气)
感谢各位指点！能不能推荐一些入门的书籍（外文的）？
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9楼2010-05-07 11:54:49
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vasp001

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):感谢参与讨论 2010-05-13 12:34:09
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-05-06 18:37:29:
我来说说,不对的地方请帮提高.
MD与DFT(专指基态能量有关的量,如电子结构,吸附态,过度态等)的区别,在于处理问题的方法和目的.
DFT通过自洽迭代的方法在找到能量最低点,然后分析这一过程中的能量,坐标和电子结构 ...

不是遍历每一个构像吧。对于力是有一定的搜索方向的，是沿着力最小的方向进行搜索的,这是VASP 里的用法。你说的方法像M-C simulation.
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一定要精通MaterialsStudios,VASP.
10楼2010-05-13 11:12:37
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