| 查看: 837 | 回复: 2 | |||
[交流]
【求助】求教NAMD的DCD轨迹合并问题 已有2人参与
|
| 在WINDOW下进行NAMD的运算，在途中断电重启后，利用RESTART接着计算，但是如何合并重启前和重启后的DCD文件呢？CATDCD用不了，因为是WIN下，不知道各位知不知道如何合并？想利用整个轨迹做下RMSD的分析 |
回复此楼» 猜你喜欢
求调剂
已经有14人回复
-
273求调剂
已经有43人回复
-
307求调剂
已经有13人回复
-
327求调剂
已经有7人回复
-
338求调剂
已经有6人回复
-
326分，一志愿沪9，求生物学调剂
已经有3人回复
-
材料科学与工程320求调剂，080500
已经有9人回复
-
0703化学调剂 348分
已经有10人回复
-
一志愿211，0703化学305分求调剂
已经有15人回复
-
284求调剂
已经有14人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助仿制药的一个处方方面的问题
已经有10人回复
- 稳定性试验与相容性试验的关系、药品保质期的问题
已经有5人回复
- 蚜虫 GC-EAD交流（求教）
已经有9人回复
- 求教一个反应的机理
已经有10人回复
- FLUENT非定常问题中的速度监测和轨迹追踪
已经有20人回复
- 求教一个手机软件的问题！！
已经有4人回复
- 想退站，有几个重要问题求教大家
已经有25人回复
- 求教制作Ag nanoparticle的问题
已经有12人回复
- 求教空调房的相关问题
已经有6人回复
- 用什么软件处理namd跑出来的dcd文件
已经有9人回复
- 【求助】在NAMD运行中使用CHARMM格式的力场文件，但力场参数来自AMBER力场，会出问题�
已经有4人回复
- 【求助】菜鸟求教一些关于塑料加工实验的问题
已经有5人回复
- 【求助】build layer合并两个界面时的小问题
已经有22人回复
bay__gulf
金虫 (著名写手)
刘苏州
- 模拟EPI: 8
- 应助: 9 (幼儿园)
- 贵宾: 4.85
- 金币: 2332.8
- 红花: 1
- 帖子: 1344
- 在线: 271小时
- 虫号: 592012
- 注册: 2008-09-03
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
★ ★ ★
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-04 16:13:54
zh1987hs(金币+5):谢谢BAY兄，开始想在答疑帖里问你的，后来发现进不去！郁闷啊~哈哈 2010-05-04 16:29:27
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-05-04 16:13:54
zh1987hs(金币+5):谢谢BAY兄，开始想在答疑帖里问你的，后来发现进不去！郁闷啊~哈哈 2010-05-04 16:29:27
|
有catdcd 的代码, 但我无法在windows 下编译 可以用vmd 合并, 先同时载入两端轨迹, 然后参考 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2007572 缺点是总的长度不能超过系统能提供的内存, 功能有限 两端轨迹除了不方便保存外, 没有什么别的不便 |
2楼2010-05-04 15:51:37
3楼2010-06-23 09:50:42
