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156727932

[交流] 【求助】MSD 已有4人参与

各位大侠,在用Forcite模块做完Dynamic后,得到一个轨迹文件,如何由这个轨迹文件来计算MSD???Set如何设置???求高手解答。
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水晶蚂蚁

金虫 (小有名气)


156727932(金币+2): 谢谢参与
你在xtd 文件中先设定set,如果你考察的是一个分子的话,双击该分子,选择edit --set .出现一个对话框,默认改set为new set ,名字你也可以改。然后你点击forcite 有个analysis,出现一个对话框,最上面有一个mean square displacement。就是MSD ,单击,然后下面有选择set的框,你再设定一下时间起始时间,就可以开始计算了。希望有所帮助
玫瑰花苞
7楼2012-09-07 09:19:29
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zxc1230

银虫 (小有名气)


156727932(金币+2):谢谢参与
好问题
我期待高手
2楼2010-04-27 18:22:26
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freer007

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
156727932(金币+2):谢谢参与
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-04-27 20:36
Set设置方法有两种,不同之处在与set中原子的选择
其一,直接选择原子;
其二,edit>Atom selection对话框,在select by property下拉选项里设置element,在下面选择is,后面选需要设置的元素,然后点最下面的select。
最后,edit>Edit Sets,在对话框中点New,设置name,OK。
Sets设置完之后,在Forcite模块用Analysis来分析即可。
3楼2010-04-27 19:37:46
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meimeinn

银虫 (小有名气)


156727932(金币+2):谢谢参与
但是必须是全轨迹
4楼2010-04-28 20:03:26
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