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156727932

[交流] 【求助】MSD 已有4人参与

各位大侠，在用Forcite模块做完Dynamic后，得到一个轨迹文件，如何由这个轨迹文件来计算MSD？？？Set如何设置？？？求高手解答。
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1楼 2010-04-27 16:16:53
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zxc1230

银虫 (小有名气)
★
156727932(金币+2):谢谢参与
好问题
我期待高手
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2楼2010-04-27 18:22:26
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freer007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
156727932(金币+2):谢谢参与
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-04-27 20:36
Set设置方法有两种，不同之处在与set中原子的选择
其一，直接选择原子；
其二，edit>Atom selection对话框，在select by property下拉选项里设置element，在下面选择is，后面选需要设置的元素，然后点最下面的select。
最后，edit>Edit Sets，在对话框中点New，设置name，OK。
Sets设置完之后，在Forcite模块用Analysis来分析即可。
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3楼2010-04-27 19:37:46
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meimeinn

银虫 (小有名气)
★
156727932(金币+2):谢谢参与
但是必须是全轨迹
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4楼2010-04-28 20:03:26
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156727932

引用回帖:
Originally posted by meimeinn at 2010-04-28 20:03:26:
但是必须是全轨迹

不太懂啊，什么必须是全轨迹？？？
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5楼2010-04-29 08:53:44
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liangjun44

至尊木虫 (著名写手)
★
156727932(金币+2): 谢谢参与
引用回帖:
427452楼: Originally posted by 156727932 at 2010-04-29 08:53:44
不太懂啊，什么必须是全轨迹？？？

就是 在Forcite Analysis选项卡中，选择Trajectory，然后点后面的有三个点的按钮，默认为All，就是所谓的全轨迹，应该是这样了~
欢迎补充或改正
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6楼2012-09-05 20:37:00
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水晶蚂蚁

金虫 (小有名气)
★
156727932(金币+2): 谢谢参与
你在xtd 文件中先设定set,如果你考察的是一个分子的话，双击该分子，选择edit --set .出现一个对话框，默认改set为new set ,名字你也可以改。然后你点击forcite 有个analysis，出现一个对话框，最上面有一个mean square displacement。就是MSD ，单击，然后下面有选择set的框，你再设定一下时间起始时间，就可以开始计算了。希望有所帮助
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玫瑰花苞
7楼2012-09-07 09:19:29
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动感球球

木虫 (小有名气)
★
156727932(金币+2): 谢谢参与
引用回帖:
7楼: Originally posted by 水晶蚂蚁 at 2012-09-07 09:19:29
你在xtd 文件中先设定set,如果你考察的是一个分子的话，双击该分子，选择edit --set .出现一个对话框，默认改set为new set ,名字你也可以改。然后你点击forcite 有个analysis，出现一个对话框，最上面有一个mean sq ...

您好，我想请教一下如何用forcite得到轨迹文件，我用forcite进行动力学计算后得到的总是xsd文件。
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空穴来风
8楼2013-06-11 16:58:18
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动感球球

木虫 (小有名气)
★
156727932(金币+2): 谢谢参与
引用回帖:
8楼: Originally posted by 动感球球 at 2013-06-11 16:58:18
您好，我想请教一下如何用forcite得到轨迹文件，我用forcite进行动力学计算后得到的总是xsd文件。...

刚刚已解决，forcite dynamics——advanced——勾选include forces
赞一下 回复此楼
空穴来风
9楼2013-06-11 17:29:06
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