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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士

[交流] 【求助/交流】请问各位老师,用蛋白酶K去除RNASE可行吗? 已有3人参与

各位老师,我在网上偶然看到这一个帖子:
蛋白酶 K 的妙用,我曾经在别的论坛发表。坦率地说,蛋白酶 K 的这个用途,是我的得意之作之最。不是因为该发现有什么创新,而是因为它的实用性。当别人还在讨论 DEPC 有什么毒性,讨论那一家公司的 DEPC 好时,我早就在使用蛋白酶 K 替代 DEPC 实现灭活 RNase A 的目的了。[不过有一点还是要声明,我没有使用该方法制备的水用于溶解 RNA。原因不是在于我对该方法的担心,而是我没有制备高纯水 (Millipore 水) 的设备。与保存及酶反应有关的水,除了酶的残留是一个考虑因素外,水的纯度也是我考虑的;这种用途的水,我使用的是 Sigma 进口的无酶的 Millipore 水 (也不是 DEPC 处理的水)。我的用途很特殊,首先要求最高纯度的水,所以我只能付出更大的代价。]

看这篇东西,我不知道大家的最大担心是什么;最早我的最大担心是蛋白酶 K 的”尸体“是否会对后续实验产生影响。做过的实验证明我的担心是多余的。
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蛋白酶 K,威力巨大的广谱蛋白酶,95C 加热10 分钟,则完全失活。数年前首次使用它替代 DEPC 处理 RNA 抽提用的离心管和枪头,效果不错;后来又用于处理 RNase-Free的水,效果也是一级棒。从此就再也不用 DEPC 了。现在将它的细节公开,与大家分享。

配制 RNA 裂解试剂时,直接用灭菌的双蒸水配制,最后,加入蛋白酶 K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀,室温放置 15 分钟后即可。

枪头及离心管去除 RNase:先将枪头及离心管清洗干净后,移入预先混好的含 1ug/ml 蛋白酶 K 的双蒸水,彻底浸入。室温放置 30 分钟后,连水一起高压灭菌。弃水后,烘干即可。

RNase-Free 水的获得:直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶 K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀,室温放置 15 分钟后,灭菌处理即可。该蛋白质的残留对后续实验没有可见的影响。

无蛋白质残留的RNase-Free 水的获得:这比较麻烦。直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶 K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀后,倒入专用的蒸馏器中。放置 15 分钟后,加热蒸馏,流出的就是无蛋白质残留的RNase-Free 水。要提醒的是,该专用蒸馏器头几次流出来的水,只能当普通蒸馏水用,因为通道中难确保 RNase-Free 的环境;另外,一定要主要密闭性,否则,流出的水又被污染了。

我比较茫然。不知道这个帖子是不是准确的是不是可以使用的。我担心一个是效果问题,另外一个是蛋白酶K的残留问题,有些残留会不会影响到以后的实验?比如RT等等。
不知道有没有老师用过这个方法,我想请教一下~
谢谢各位老师的关注!
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士

坛子里很久以前有过类似的贴子,旧话重提~不知道有没有人用过~谢谢了;~
不孝有三,读博为大!
2楼2010-04-20 20:54:24
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

其实DEPC挺便宜的啊……配的时候又在通风橱进行,不会有什么影响~
3楼2010-04-20 22:22:24
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-04-20 22:22:24:
其实DEPC挺便宜的啊……配的时候又在通风橱进行,不会有什么影响~

就是太麻烦了。。。特别是用DEPC水配试剂的时候
不孝有三,读博为大!
4楼2010-04-20 23:24:49
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
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lstt09nk(金币+1):热心的虫友~ 2010-04-21 18:30
引用回帖:
Originally posted by yidaqunyan at 2010-04-20 23:24:49:

就是太麻烦了。。。特别是用DEPC水配试剂的时候

一点都不麻烦,我们都是常备DEPC水的
而且也不用处处都用DEPC水
耗材直接买进口,粗放的实验不需要器具去RNase
5楼2010-04-20 23:51:27
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yidaqunyan

木虫 (正式写手)

博士

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2010-04-20 23:51:27:


一点都不麻烦,我们都是常备DEPC水的
而且也不用处处都用DEPC水
耗材直接买进口,粗放的实验不需要器具去RNase

您好,能具体说一下吗?NaAC,CTAB,TrisHCl等。。都需要DEPC水啊,而且瓶子什么的都要处理。。。此外每提一两次RNA之后,试剂都要重新配啊。。
不孝有三,读博为大!
6楼2010-04-21 11:00:42
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zhenpeng84

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
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lstt09nk(金币+3):感谢交流~~ 2010-04-21 18:30
有些产品的价格确实昂贵,而且存在一定风险,同时价格也相对昂贵,。
我之前去除RNASE的时候用了好像叫一个普格斯的RNA酶清除剂,效果还不错,最高稀释比例为1:1000,价格上也不太贵,好像相比国外的一些品牌还不到一半,并且是无毒的,用起来还好,呵呵。
之前是一个朋友介绍给我用的,如果你感兴趣的话,给我邮件,我帮你找找看看还能不能找到了。
我邮箱的地址是zhenpeng84@163.com
7楼2010-04-21 17:09:54
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


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引用回帖:
Originally posted by yidaqunyan at 2010-04-21 11:00:42:


您好,能具体说一下吗?NaAC,CTAB,TrisHCl等。。都需要DEPC水啊,而且瓶子什么的都要处理。。。此外每提一两次RNA之后,试剂都要重新配啊。。

这些试剂是用来提RNA的?我们只用trizol提
8楼2010-04-21 20:33:23
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