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zouhui1115

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】用ms计算两个分子的相互作用势已有9人参与

请问高手,ms能不能这样计算两个分子间的相互作用势呢?
譬如说想计算两个C60分子之间的相互作用势,
1建立两个C60分子组成的体系,然后用Dmol3计算体系的总能量E(total);
2用Dmol3计算单个C60的总能量E(C60)
3用两个C60分子的体系的总能量减去两个单个分子的能量,
即E(total)-2*E(C60)
这样是否可以准确的得出两个C60分子之间的相互作用势呢?谢谢大家.
貌似这样计算有些问题,例如,我计算了氮分子和氧分子之间的相互作用势,
分子之间的角度如下图所示,得出相互作用势和分子中心距离的曲线
红圈部分很奇怪,一般的势能曲线应该是不会出现这种起伏的吧,
希望高手指教,非常感谢!


[ Last edited by zouhui1115 on 2010-4-21 at 12:54 ]
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wwj_0905

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
顶~同样关注
17楼2010-04-25 23:47:21
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wwj_0905

银虫 (正式写手)


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引用回帖:
Originally posted by zouhui1115 at 2010-04-22 18:19:43:
谢谢楼上的耐心回答,我只扫描了N2和O2中心距离进行计算,没有做结构优化,看到一篇文献做这个的,算了两个分子之间多种构型的相互作用势,这是其中的一种,采用的是PBE函数。文章中采用的是CPMD代码计算的,但方 ...

我觉得你最好先对两个分子的结构分别优化,然后将优化后的结构作为你计算的对象,
18楼2010-04-25 23:50:43
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