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【求助】关于mini.positions请教.... 已有3人参与
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我想进行一个min. positions优化。 在优化之前我先对体系跑了SCF达到了 CC收敛。 然后我想对这个体系某原子的Z轴位置优化 应该如何修改 case.inM文件？ 例如case.inM默认生成如下 PORT 2.00 0.35 # PORT/NEWT; tolf, Initial Trust Radius 0.0 0.0 1.0 1.0 #Atom 1 Generated by pairhess 0.0 0.0 1.0 1.0 #Atom 2 Generated by pairhess 如果我想优化的是 atom1 的z轴位置，而atom2不进行任何操作，我如下的修改对吗 PORT 2.00 0.35 # PORT/NEWT; tolf, Initial Trust Radius 0.0 0.0 1.0 1.0 #Atom 1 Generated by pairhess 0.0 0.0 0.0 1.0 #Atom 2 Generated by pairhess 我略看了下UG，大意可能是line2和line3 的前三个数是笛卡尔坐标系的三个轴，不知道我这样改对不对，如果按照我的要求是否应该把line3的第4个1.0也改成0.0 请学长们指点下，（对于第4个值理解不够请赐教）还有关于其他的参数我需要进行改动吗？比如.minpair和生成.minpair的输入文件case.inpair 是否需要改动 和改动时应该注意的地方。请大家不吝赐教。 感谢！！！ |
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空壳(金币+1):这个已经看过了，谢谢讲解。 2010-04-20 12:18
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-04-20 12:22
空壳(金币+1):这个已经看过了，谢谢讲解。 2010-04-20 12:18
gavinliu7390(金币+1):谢谢交流！ 2010-04-20 12:22
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选用PORT时, 每一行里前三位数可理解为控制x,y,z优化时步长的系数, 0值不优化. 第四位数设置为1即可,主要用于调节Hessian matrix,在PORT时影响不大. 这里有一个很好的阅读材料, http://www.wien2k.at/reg_user/textbooks/Optimization-Notes.pdf |
4楼2010-04-20 11:53:46
2楼2010-04-19 17:36:52
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