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wangdading

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】键于非键相互作用中的一点疑惑已有3人参与

我是一个初学者,我对于Gromacs中的力的形式有几点疑问。
1。 我的理解是“1-4”相互作用应该是非键相互作用,而二面角肯定不用说是键相互作用,但是这两者有交集吗?
2,    在gromacs中各种力学形式不是都定义好了吗?那为什么还要单独列出“1-4”相互作用呢?
3.    “1-4”相互作用是怎么确定的呢?那些原子之间会存在1、4相互作用呢?
应该是我理解的能力有限,可能问的问题有点弱,不过还是很希望大侠们出来指点一下,
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qasd

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-04-16 20:41
wangdading(金币+1):多谢了! 2010-04-17 14:47
1,在力来说有,二面角主要是控制分子内的结构,1-4分子内分子间的都有
2,因为默认排除是3,也就是1-4之间的力没有按非键的法则算进去
3,理论上来说都有,只是有些计算中根据要求可以不考虑
2楼2010-04-16 17:55:07
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