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ljj200511

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于生物酶的热稳定性研究! 已有5人参与

大家好啊,我现在研究的是淀粉酶和果胶酶的热稳定性。但是实验过程中出现了很多问题!比如:这两种酶的测试活力方法;在酶中加入热稳定剂后,数据的不准确性;还有在酶中,加入物质后,热稳定性的公式的推算,Arrhenius公式来算的啊,但是按照这个公式,拟合出来应该是直线,但是实际上数据很乱,现在我也不知道怎么办啦,请各位高手帮帮忙啊!非常感谢!
方法一:
如果α-淀粉酶的失活遵循一级动力学,则我们可以得到:lnA=-kt+lnA'
中A'为α-淀粉酶的初始酶活,A为孵化时间为t时的剩余酶活,k为失活速率常数。以lnA对t作图,通过线性拟合求得的斜率即为α-淀粉酶在此温度下的失活速率常数k。

根据Arrhenius公式,lnk=-Ea/RT+C     
其中,Ea为失活活化能,T为孵化时的绝对温度。在温度变化范围不大时,活化能可以看作常数,以lnk对1/T作图应得直线,通过斜率可算出活化能Ea。
不同温度下α-淀粉酶的活化焓和失活自由能分别为:
在溶液中反应时,  △H=Ea+△pV约等于Ea     (2-4)
                              △G=-RTln(kh/KT)                (2-5)
其中,h (6.6262×10-34 J)为 Planck 常数, K (1.3806×10-23 J K-1) 为Boltzmann 常数。α-淀粉酶的热失活活化熵(ΔS)可通过式(2-4)和(2-5)计算:
                ΔS=( △H -△G )/T


这是我找到的一种方法,还有一种算法我放在下面


方法二:
α-淀粉酶的热变性
不同浓度的助溶剂对α-淀粉酶的热变性的影响通过分光光度计在287nm处比色皿厚度1cm,扫描速率1℃/min,温度范围在30至90℃测试。α-淀粉酶的(Tm)app通过计算原始和变性后酶的状态得到。酶的片段展开(Fu)在不同温度下获得,(Tm)app通过下式计算得到:
Fu=(At-An) /(Ad-An)                                              (3)
式中,An和Ad分别是蛋白质原始和变性后的吸光度,At是在T温度下蛋白质的吸光度。在(Tm)app的标准焓变(∆H)和标准熵变(∆S)通过蛋白质变性平衡系数计算得来.
K=Fu/(1-Fu)                                           (4)
    △G=-RTlnK                                           (5)
在(Tm)app下蛋白质的原始和变性的状态处于平衡,因此K=1,∆GO=0。计算式如下:
    ∆S=∆H/T                               (6)
    ∆H=-Rd(lnK)/d(1/T)                                  (7)
式中R是通用气体常数,T是绝对温度。


想请问下大家,关于这两个求热稳定性的公式,哪一个好些,我不知道该怎么办了,我也不是学生物专业的,现在做这个实验很头疼!
还有就是,在第一个方法中提到了如果α-淀粉酶的失活遵循一级动力学,他只是说如果,可是只要做过实验的人都会觉得,拟合出来根本就不是直线,那我自己拟合
怎么办啊,因为动热力学的公式很多,有很多拟合的结果,有的是一级的,有的是二级的,还有更高级的啊!如果大家有这方面好的文献,可以给我看看吗?
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chenyyy

无虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这方面真不太懂
帮你顶起来,期待专家给你解决
2楼2010-04-14 15:43:16
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ljj200511

新虫 (小有名气)

谢谢,真的是遇到了很多问题,老板也忙,也不是什么问题,他都能够帮我解决的啊,只有我自己想办法了!
3楼2010-04-14 16:00:28
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3sgentlman

金虫 (小有名气)

数据太乱可以
路是大家共同开发的!
4楼2010-04-14 17:45:41
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3sgentlman

金虫 (小有名气)

★ ★
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hawkyin(金币+1):谢谢回帖 2010-04-16 10:35
可以用EXCEL中的数据统计(回归线方程)来整理一下!嘿嘿……好好加油!顶一下!
路是大家共同开发的!
5楼2010-04-14 17:48:08
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jikelo

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我下个星期也要开始测酶活动力学,不过要下个星期才开始,也不是淀粉酶。
6楼2010-04-14 21:31:05
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okchzhf

银虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
hawkyin(金币+1):谢谢回帖 2010-04-15 10:46
楼主提出的公式我是没有用过的,但是如果楼主的试验目的是研究不同热稳定剂对提高酶制剂热稳定性的效果的话,建议可以采用相对简单的方法。
在酶制剂或酶溶液中加热你所研究的热稳定剂,然后再你所研究的温度梯度下进行保温比如30min、1h或更长时间,然后测定不同温度下酶制剂或酶溶液的残留酶活,以未保温前的酶活为基数,这就可以通过残留酶活的比列比较出不同热稳定剂的效果了。
7楼2010-04-14 22:09:59
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okchzhf

银虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
hawkyin(金币+1):谢谢回帖,欢迎新虫 2010-04-15 10:46
另外,酶制剂的活化能应该是针对某个特定的酶促反应而言的,如果反应底物固定了,其活化能是一样的,测定活化能,是通过测定不同底物浓度下该酶制剂催化酶反应的反应初速度来计算出来的。加入不同的热稳定剂只能提高酶制剂的热稳定性,一般不会改变酶制剂的活化能。但对于部分酶制剂,加热Ca离子或其他一些金属离子等,倒是可以起到提高热稳定性并同时降低活化能的效果,从而可以起到加速酶促反应速度的效果。
一点意见,希望对你有用。
8楼2010-04-14 22:15:38
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ljj200511

新虫 (小有名气)

谢谢大家啊,一头雾水!
9楼2010-04-15 11:02:55
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