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【求助】Dmol3优化结构有虚频
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ndxiaoxiao
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【求助】Dmol3优化结构有虚频
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优化出现虚频怎么去掉呢??怎样通过振动模式调节呢??请高手详细指导下!O(∩_∩)O谢谢!!!
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2010-04-11 21:26:51
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qasd(金币+2):谢谢 2010-04-12 21:54
找出振动模式
沿着虚频的振动模式给出的位移方向
移动原子位置
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2010-04-11 21:56:02
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Originally posted by
xirainbow
at 2010-04-11 21:56:02:
找出振动模式
沿着虚频的振动模式给出的位移方向
移动原子位置
移动多大的距离 ?有没有判断标准 ?
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3楼
2010-04-11 23:17:39
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xirainbow
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qasd(金币+1):谢谢 2010-04-12 21:54
没有标准
只有经验
高斯好像是乘以0.1
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4楼
2010-04-12 08:55:13
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ndxiaoxiao
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有一个虚频可以认为是稳态ma ?
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2010-04-12 10:07:48
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Originally posted by
ndxiaoxiao
at 2010-04-12 10:07:48:
有一个虚频可以认为是稳态ma ?
提问时,要尽可能的给出更多的信息的细节
一个虚频?!
频大小是多少?
虚频对应的振动模式是平移模么?
没有这些信息
没人能给你答案
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2010-04-13 15:02:16
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uuv2010
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移动多大的距离 ?有没有判断标准 ?
图上能不显示表示方向的箭头,有的话,移动到箭头的中间就差不多啦。
这GS下这么设置一般都能消掉。
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7楼
2010-04-13 17:12:19
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xirainbow
at 2010-04-13 15:02:16:
提问时,要尽可能的给出更多的信息的细节
一个虚频?!
频大小是多少?
虚频对应的振动模式是平移模么?
没有这些信息
没人能给你答案
您好!我也出现了和版主一样的问题,有一个虚频,大小:
vibrational frequencies, intensities
mode au_amu cm-1 km/mol
1 -0.004711 -24.2 0.30
对应的振动是平移振动,那这样可以说是稳态吗?
谢谢!
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8楼
2010-04-19 11:29:19
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gavinliu7390(金币+1):谢谢交流! 2010-04-26 15:10
找到虚频振动坐标
把xsd存为mol,用写字板打开,里面有各原子坐标
把虚频坐标一半加到相应原子坐标上,以之为初始即可
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9楼
2010-04-26 15:01:11
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在MS的存储地方有一个隐藏的文件夹
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zzy870720z(金币+1):感谢交流 2010-08-10 11:06:57
在MS的存储地方有一个隐藏的文件夹。显示隐藏文件夹之后看里面有原子坐标的!我看到虚频一般是相应的虚频相加乘以0.5在加到相应的原子坐标里面带回高斯接着计算,这一招还行,一般能消掉虚频,,,,LZ试试看,,
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10楼
2010-05-01 00:01:47
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