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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 【其他】请教一个问题
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wu3833145

木虫 (正式写手)

[交流] 【其他】请教一个问题 已有3人参与

本人刚从事一项研究，大概的目的是有一类化合物（由某几个物质以及它们的衍生物组成），它们在治疗脑血管疾病方面具有潜力，但是具体治疗的靶点不是很清楚，所以如果用分子对接的方法没有靶蛋白，但是化合物在体内转运的过程中会遇到很多蛋白，比如说转运蛋白，外排蛋白等等，想利用CADD的方法对这些化合物进行一个初步的筛选，但是有些软件没有，比如说CoMFA, 同源建模等，希望能有人给予帮助和指导
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1楼 2010-04-09 17:22:11
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wu3833145

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by wu3833145 at 2010-04-10 10:04:29:
关键是别人用DOCK 都是有靶点蛋白啊。。。我们这里的这个靶还不是很明确

可否提供点明确的文献啊，新手请求帮助啊
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5楼2010-05-04 16:16:03
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fmtzhangli

金虫 (小有名气)
★
wu3833145(金币+1):感谢支持啊 2010-04-10 10:04
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-10 10:15
这样的用分子对接，autodock，dock
不知道蛋白质结构了用同源建模，modeller等
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2楼2010-04-09 21:14:45
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wu3833145

木虫 (正式写手)
关键是别人用DOCK 都是有靶点蛋白啊。。。我们这里的这个靶还不是很明确
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3楼2010-04-10 10:04:29
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tan_yu

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-04-10 12:10
wu3833145(金币+1): 2010-04-16 21:20
雪狼乖乖(金币+2):你的建议不错 谢谢参与 2010-05-04 22:12:14
靶不明确的就不要考虑受体了，采用基于配体的方法，如粗筛做个药效团，DS软件中的就可以，比较简单，详细点的就再做个2D-QSAR，这些方面的文献还是挺多的，相关软件站里也可能找得到
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4楼2010-04-10 11:09:19
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