| 查看: 4223 | 回复: 17 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
【原创】HRM技术应用于SNP、突变和甲基化检测 已有14人参与
|
||||
|
现阶段,大家检测SNP时都用一贯的检测方法,包括测序,探针还有DHPLC等等,而甲基化大多用MSP.至于HRM技术(高分辨率溶解曲线技术)并不为大家所熟知,有两个原因:1)适合做HRM技术的仪器太少了,而且在国内的普及程度不高,具我了解能够做HRM的有Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 6000,ABI 7500 Fast和ABI7900HT Fast,Idaho LightScanncer.其中罗氏的480在其软件分析上是做的最好的.2)HRM的实验灵敏度太高,影响实验因素过多,很多人都做了,但是就是做不出来.因此就放弃,就换用其他比较成熟的方法.殊不知,HRM技术的检测方法有其他技术难以比拟的优势，不仅能实现高通量和高精度的同时,PCR和荧光定量在同一管内进行,能够有效避免假阳性. 作为新一代的遗传扫描工具,HRM具有"简,效,快,廉"等其他技术难以比拟的优势: 简:无需序列特异性探针,不受碱基位点局限,同时检出已知或未知突变、SNP和甲基化位点：闭管操作，避免交叉污染。 效：最低检测0.1%-0，01%的突变或异常甲基化，检测SNP灵敏度和特异性均为100%。 快：1次同时不多于384个样本，在60-90分钟内完成检测。 廉：简化操作步骤、降低人工和试剂成本，费用远少于测序、Taqman探针等方法。 HRM技术特别适用于样本量多、检测位点较少的SNP、突变或甲基化分析，是不同于基因芯片检测方法（检测位点多，样本少）的高通量方法。同时，也是基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的最佳方法。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 表观遗传 |
» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有214人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 紫外检测器显示over
已经有7人回复
- 有没有中国日化研究所的师哥师姐啊
已经有5人回复
- 气相色谱法检测氨基甲酸乙酯
已经有5人回复
- 大家一起来总结实验中各种化合物“去水”方法
已经有22人回复
- 交流乳化剂测定乳化性时乳化粒径问题
已经有6人回复
- [求助]光催化甲基橙
已经有11人回复
- 宁东能源化工基地开发总体规划咨询评估报告
已经有6人回复
- 板框式水洗压滤机洗涤硅酸镁
已经有5人回复
- 吸收光谱模拟与实验不符，大侠们帮忙分析下！
已经有4人回复
- 求 石油加工工艺总流程图 急用
已经有16人回复
- 【课件】很全的SNP检测技术，及各种检测技术简介
已经有52人回复
- 提供Sequenom MassARRAY®甲基化及SNP检测分析服务
已经有57人回复
- 【求助】关于增塑剂对于坯料增速效果的量化标准。
已经有3人回复
- 【求助/交流】HRM技术的几个问题
已经有23人回复
- 【专题】HRM技术介绍
已经有6人回复
holyala
木虫 (著名写手)
砖家
- MolEPI: 7
- 应助: 19 (小学生)
- 贵宾: 0.001
- 金币: 1115.7
- 散金: 322
- 红花: 20
- 帖子: 1869
- 在线: 268.6小时
- 虫号: 457557
- 注册: 2007-11-12
- 性别: GG
- 专业: 基因组学
7楼2010-07-21 10:58:51
zzw1221
木虫 (著名写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3864.2
- 散金: 106
- 红花: 3
- 帖子: 1488
- 在线: 219.9小时
- 虫号: 611599
- 注册: 2008-09-24
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
2楼2010-04-06 21:18:54
3楼2010-04-09 09:24:34
snp、突变和甲基化实验解决的更佳方案
|
HRM介绍 HRM技术是high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术，是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的PCR技术，HRM不受突变碱基位点与类型局限，无需序列特异性探针，在PCR结束后直接运行高分辨熔解，即可完成对样品突变、单核苷酸多态性-SNP、甲基化、HLA配型等的分析。 HRM原理 HRM的主要原理是根据DNA序列的长度，GC含量以及碱基互补性差异，应用高分辨率的熔解曲线对样品进行分析，极高的温度均一性和温度分辨率使分辨精度达到对单个碱基差异的区分。 HRM应用 l SNP（单核苷酸多态性）的筛查。 l 基因突变扫描，包括缺失、重复、点突变。 l 新突变的筛查。 l 甲基化的筛查。 l 遗传育种中特定突变的筛查、未知突变的发现。 l HLA基因组配型、等位基因频率分析、物种鉴定、品种鉴定、甲基化研究。 l 法医学鉴定、亲子鉴定。 l 动植物品质相关多态性位点的研究等。植物抗逆性，突变与性状关联性研究。 |
4楼2010-06-11 14:55:50
40