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dnp

荣誉版主 (知名作家)

小木虫浪子

优秀版主

[交流] 【讨论】质谱选择性裂解的判断

想和大家讨论一个一直困扰我的问题,附图是两个质谱图,第一个质谱图是有几个很高的峰,第二个质谱图是一个非常强的基峰,对于峰的标记我们可以忽略,不同的领域峰的标记不一样。我想问的问题是如何定义选择性裂解?

第一个图中的几个高峰,都可以被定义为选择性裂解而产生的峰么?还是只有第二幅图中那个基峰属于选择性裂解而产生的?

很难理解选择性裂解这种定义,按照我的理解,质谱中选择性裂解是在某个或某几个特定的位点断裂,形成高的峰,而其他位点则不会或很少断裂,形成很低的峰。那这个选择性裂解应该如何定义,或者按照数学上来讲,应该有一个判断标准来定义这个选择性裂解,这个标准是什么?比如第二强的峰强度比最强峰的强度<0.5,那最强的那个峰可以说明为选择性裂解,因为可以说这个分子被裂解时选择性的在那个地方断裂。可是比较糊涂的是第一个图应该怎么判断?那最高的几个峰都属于选择性裂解么?

不知道大家的看法是什么?或者有什么资料对这种选择性裂解进行说明与讨论的?

呵呵,谢谢大家,也希望大家能够帮忙解答!

图一:


图二:
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supercat0821

至尊木虫 (职业作家)

dnp(金币+5):谢谢您参与讨论:) 2010-03-23 14:18
对于气质来说,一般用的是EI源,作为硬电离源,它能把物质打成片段。而裂解产物中比例较大的碎片一般应该是由于易断裂的或者易发生氢转移的原因产生的,应该是越容易断裂的地方,生成的对应的碎片越多。个人觉得
2楼2010-03-23 13:33:26
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dnp

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小木虫浪子

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引用回帖:
Originally posted by supercat0821 at 2010-03-23 13:33:26:
对于气质来说,一般用的是EI源,作为硬电离源,它能把物质打成片段。而裂解产物中比例较大的碎片一般应该是由于易断裂的或者易发生氢转移的原因产生的,应该是越容易断裂的地方,生成的对应的碎片越多。个人觉得

嗯,是的,所以形成的碎片峰也就越高,不过这个和选择性裂解,比如在气质中,某些地方很容易断裂形成非常强的基峰,有些分子是有几个地方特别容易断裂,形成几个很强的峰,就是后者是否属于选择性裂解,而作为判断选择性裂解,在一个质谱中,要多强的峰才算选择性裂解?

呵呵,谢谢您的讨论。
What would Jesus do?
3楼2010-03-23 14:18:12
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anwen1999

木虫 (小有名气)

dnp(金币+8):非常感谢您的讨论:) 2010-03-23 15:22
基峰只指最高的那个,定义为100%,其余的皆与之比较。只是一个强度上的比较。
质谱图里要关注的是分子离子峰和经典的碎片离子峰。
常用的有软电离和EI源。软电离(液质)基本上都是分子离子峰,除非结构极易碎裂,一般是+H、-H、+Na、+K之类的(也有2M)。EI源(气质)轰击的离子,除了分子离子峰,较多的都是碎片离子峰,碎裂程度与你的EI强度有关系,一般用的都是70ev(最合适的强度)。
但是,产生的碎片于这些关系甚少,主要还是看你的结构。断裂方式就那么几种,加上迁移重排,基本上都能推测的出来(重点就在于看你分子结构中有杂原子的地方)。但真要说谁强谁弱只是大概有个趋势,即某一种碎裂方式占主导地位,并不能绝对的量化。除了一次碎裂外,还有多次碎裂,所以很难估计。
再说,一个峰并不一定都是某一个离子的,如果两个碎片离子拥有相同的荷质比,它们会在同一个坐标上出峰。
所以拿到谱图前,应该先写出该分子可能的碎裂方式,再和谱图比较。出峰的位置差的太多就很难讲了~~~
上善若水,人淡如菊
4楼2010-03-23 15:10:06
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dnp

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小木虫浪子

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引用回帖:
Originally posted by anwen1999 at 2010-03-23 15:10:06:
基峰只指最高的那个,定义为100%,其余的皆与之比较。只是一个强度上的比较。
质谱图里要关注的是分子离子峰和经典的碎片离子峰。
常用的有软电离和EI源。软电离(液质)基本上都是分子离子峰,除非结构极易碎裂 ...

呵呵,谢谢讨论

在机理上是这么说的,如果某一个重排方式或者电子(质子)特别容易发生或聚集在某一个基团上,那可以说这个会发生选择性裂解,即产生强的基峰,而其他地方就很难发生断裂,对于碎片再裂解,的确很难预测。

现在的问题是,在什么样的条件下,才能说明这个是发生了选择性裂解?即在某一个质谱中,相对于其他的峰,要产生多高的峰强度才能说明这个峰对应的碎片是由原来分子中选择性裂解而产生的,在这里不考虑那种因为有同一质荷比而产生的碎片的情况。
What would Jesus do?
5楼2010-03-23 15:21:40
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yuzhan

木虫 (正式写手)

Keep moving forward

选择性裂解?selective fragmentation?印象中这个词不是常见的质谱术语。没看懂楼主的问题。

PS:楼主难道是在讨论重排(rearrangement)吗?还是在讨论碎裂的机理(fragmentation pathway)?的确没看懂,可否找一个英文的文献支持一下你的问题呢?
6楼2010-03-23 16:34:50
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dnp

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引用回帖:
Originally posted by yuzhan at 2010-03-23 16:34:50:
选择性裂解?selective fragmentation?印象中这个词不是常见的质谱术语。没看懂楼主的问题。

PS:楼主难道是在讨论重排(rearrangement)吗?还是在讨论碎裂的机理(fragmentation pathway)?的确没看懂,可 ...

selective cleavage

文献不知道是否可以看elsevier的International Journal of Mass Spectrometry杂志的文章呢?可以的话,直接链接看全文
http://www.sciencedirect.com/sci ... 8402339b73f3fde553f

选择性裂解指的不是机理上的问题,虽然根本问题是机理问题,但是对于质谱来讲,就像图二中,有一个非常高的基峰,而其他的碎片峰都非常低,那我就可以认为这个是由选择性裂解产生的,因为产生这个质谱的分子,被轰击后断裂的位置非常估计,而且产生之后的碎片离子非常稳定,以至于产生这个很强的峰。说明对于这个分子,在我当前的实验条件下,选择性的在这个地方断裂,而不是随机性的在这个分子的所有地方断裂。

因为产生一个很强的峰,需要有非常大的几率在一个位点断裂形成碎片离子,并且该碎片离子还要非常稳定,这个在质谱里面是很常见的,就像上面所解释的,我们可以定义为这种现象是由选择性裂解产生的。我的问题是,就图一来讲,同时有几个非常强的峰,其他峰很低,或者有另外一些质谱,几乎所有的峰都很强,那我在判断最高的几个峰是不是由于选择性裂解而产生的,判断标准是什么?

撇开机理,就经验判断,对于一个质谱,一个质谱峰(也许不是基峰)要达到多高的强度才算属于选择性的在分子中断裂,而非随机的断裂产生的?
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7楼2010-03-23 18:14:38
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yuzhan

木虫 (正式写手)

Keep moving forward

dnp(金币+10):谢谢您的讨论,呵呵,感觉有点不是在讲同一个问题,不知道我的回复可以明白么? 2010-03-24 09:09
多谢提供文献链接,大致看了一下,了解了其中的内容。不同的阳离子会导致不同类型的碎片。这个是很自然的,我做环糊精时,特意比较过质子化的、铵离子化的、钠离子化的环糊精的碎片,也有类似的规律。

一般情况下,在MS/MS中看到的碎片都是选择性的,也就是说,都是薄弱的化学键断裂后产生的,或再经过重排后产生的。这是由于能量决定的。即便是在70 ev的EI下,也不是所有的键都会断掉。

峰的高低并不重要,能量调高一点碎片峰自然就高了。据别人说,cooks组里面的MS/MS谱图一般将母离子的强度为100%,最大强度的子离子强度为50%左右。忘记谁告诉我的了,不过这样子的谱图比较好看。
8楼2010-03-23 19:54:40
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yunmeng6001

金虫 (著名写手)

你的意思是要个标准?基峰和其他的峰大概比例是多少才算这个条件是选择性裂解合适的?不知俺理解的对不?
心中若无烦恼事便是人生好时节
9楼2010-03-23 20:30:11
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dnp

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小木虫浪子

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引用回帖:
Originally posted by yunmeng6001 at 2010-03-23 20:30:11:
你的意思是要个标准?基峰和其他的峰大概比例是多少才算这个条件是选择性裂解合适的?不知俺理解的对不?

是的,没有问题,呵呵,不知道您的看法是什么?谢谢
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10楼2010-03-24 08:52:32
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