24小时热门版块排行榜    

查看: 2255  |  回复: 12

piaoma

木虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】用gaussian进行SCS-mp2计算

最近琢磨怎么用gaussian来做scs-mp2 文献见S.Grimme     J. Chem. Phys   2003,118,9095
需要用到gaussian计算结果的数据,如下(为g03的输出文件)

Spin components of T(2) and E(2):
     alpha-alpha T2 =       0.9386991328D-01 E2=     -0.2551138229D+00
     alpha-beta  T2 =       0.4903096895D+00 E2=     -0.1496720103D+01
     beta-beta   T2 =       0.9386991328D-01 E2=     -0.2551138229D+00
ANorm=    0.1295395506D+01
E2 =    -0.2006947749D+01 EUMP2 =    -0.49555972975718D+03

1)alpha-alpha、alpha-beta  和beta-beta 应指电子的自旋情况。请问 T2 和E2指什么?
2)分子能量应为EUMP2 那E2又是指什么呢?
请指教.

[ Last edited by piaoma on 2010-3-21 at 20:32 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★
piaoma(金币+3):谢谢参与
yjcmwgk(金币+1): 2010-03-22 13:46
why not use ORCA? This method has been implemented in this free soft.
前途光明,出路难觅!
2楼2010-03-21 21:27:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoma

木虫 (小有名气)

我知道 orca可以,但是作者的文献明确说通过gaussian03的输出文件(我所给的那一段)是可以换算出来的。现在的问题是不知道取哪一项数值。我实在不想为这个再去研究orca了,而且我的分子对称性高,怕orca处理不好
3楼2010-03-21 22:17:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫



piaoma(金币+3):谢谢参与
piaoma(金币+50): 2010-03-22 10:54
T2应当是其文中公式8,是构建校正能的中间量,这不用考虑。
列出来的三个E2分项是每类电子对儿对总校正能的贡献,三项相加就是下面的总校正能E2=-0.2006947749D+01 。总校正能E2加到HF能量上就是EUMP2。

SCS-MP2校正能应当为1.2*-0.1496720103D+01 + 1/3*(2*-0.2551138229D+00),加到HF能量上就是SCS-MP2能量。建议用文中的结构和基组计算与原文对照一下。
4楼2010-03-22 04:28:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

It can be separated further into a sum over antiparallel- and
parallel-spin components,
Ec=ES+ET,where ES and ET are given by contributions from electron
pairs with aa, bb, and ab spin as,我理解ES是自旋平行的,而ET则是自旋反平行的了。而实际情况恰恰相反,我的理解有问题吗?
前途光明,出路难觅!
5楼2010-03-22 09:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★ ★
piaoma(金币+40): 2010-03-22 10:54
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-23 13:37
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-03-22 04:28:30:
T2应当是其文中公式8,是构建校正能的中间量,这不用考虑。
列出来的三个E2分项是每类电子对儿对总校正能的贡献,三项相加就是下面的总校正能E2=-0.2006947749D+01 。总校正能E2加到HF能量上就是EUMP2。

SCS- ...

根据您的提示以及JCP, 118,9095中结论部分的这句话“One important aspect of the idea is to require that the total correlation energy after scaling (roughly) equals the unscaled MP2 energy.“ J. Chem. Phys. 129, 024103 (2008),这篇文献中的公式5
E(MP2) = E(HF) + Ec = E(HF) + c↑↓Ec↑↓ + 0.5c↑↑Ec↑↑ + 0.5c↓↓Ec↓↓,
应该是错的,我觉得应该没有前边的系数1/2了。c↑↓=1.2, c↓↓=0.33
请您指教。理由如下:

Ec =  c↑↓Ec↑↓ + 0.5c↑↑Ec↑↑ + 0.5c↓↓Ec↓↓=1.2*-0.1496720103D+01 + 0.33* -0.2551138229D+00 = -1.8806 不等于E2 = -0.2006947749D+01 ,
而略去二分之一时:
Ec =  c↑↓Ec↑↓ + 0.5c↑↑Ec↑↑ + 0.5c↓↓Ec↓↓=1.2*-0.1496720103D+01 + 2*0.33* -0.2551138229D+00 = -1.9643 约等于E2 =-0.2006947749D+01
前途光明,出路难觅!
6楼2010-03-22 09:39:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoma

木虫 (小有名气)


yjcmwgk(金币+1): 2010-03-23 13:37
感谢sobereva和lihb734的讨论。
我基于我的理解,试着回答一下lihb734的问题。欢迎讨论。
问题一:我认为你的理解是错了
问题二:正常的Eump2的能量即为Ehf+E2;scs-mp2的方法其实是对E2的校正;所以Ec和E2的值不一致才体现了矫正的效果啊
7楼2010-03-22 15:50:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★
yjcmwgk(金币+2): 2010-03-23 13:37
引用回帖:
Originally posted by piaoma at 2010-03-22 15:50:54:
感谢sobereva和lihb734的讨论。
我基于我的理解,试着回答一下lihb734的问题。欢迎讨论。
问题一:我认为你的理解是错了
问题二:正常的Eump2的能量即为Ehf+E2;scs-mp2的方法其实是对E2的校正;所以Ec和E2的值不 ...

对于一:是否意味着英语的习惯没有中文的一一对应的意思啊?我看那句话如果一一对应的话应该是这样的。
对于问题二:我想说明是在公示中是否有这个系数1/2。
Grimme说过,Ec应该(近似)等于E2的,SCS-MP2的目的是为了更准确的考虑自旋平行的、自旋反平行的相关能的分量,而不是相同权重的考虑。所以对于第二个问题我觉得你可能理解错了。
前途光明,出路难觅!
8楼2010-03-22 16:01:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
yjcmwgk(金币+3): 2010-03-23 13:37
文中的这句话容易造成误解:
ES and ET are given by contributions from electron pairs with aa, bb, and ab spin as...
他的顺序表面上反了,但是并没有说respectively。而且他的意思是让读者看下面的式子,下面的式子含义正确。所以这没必要追究这句话。正确意思就是ET是自旋平行的贡献,ES是反平行的贡献。

文中那个1/2应当没有实际意义。文中Ec=ES+ET,高斯输出中Ec=E2=E2↑↓+ E2↓↓+E2↑↑,显然E2↓↓+E2↑↑=ET,故高斯输出的E2↓↓和E2↑↑就对应文中式2的两项(包括了1/2)。
9楼2010-03-22 16:53:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoma

木虫 (小有名气)

问题一 Grimme的03年另一篇文献(journal of computational Chemistry vol24 No13 1530-1537) 对顺旋反旋描述的顺序就对了 你可以看看
10楼2010-03-22 16:59:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 piaoma 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 准备明年的基金了 +7 Tide man 2026-07-27 7/350 2026-08-02 16:43 by gltch
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 9/450 2026-08-02 16:32 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:32 by jHcrHMhbKCFV
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 19/950 2026-08-02 16:24 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 19/950 2026-08-02 16:23 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +18 低垂的野花 2026-07-31 24/1200 2026-08-02 16:03 by swallowwh
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +9 archvillain 2026-08-02 11/550 2026-08-02 15:44 by alexon
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 12/600 2026-08-02 13:43 by jHcrHMhbKCFV
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 16/800 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 21/1050 2026-08-02 10:56 by iaeyuan
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 10/500 2026-08-02 10:00 by 锦衣卫寒战
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 7/350 2026-08-02 07:59 by 88817753
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
信息提示
请填处理意见