应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】DS中CDOCKER的操作
71/1返回列表
查看: 1169  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 puffy581 的 12 个金币 ，回帖就立即获得 2 个金币，每人有 1 次机会

puffy581

捐助贵宾 (正式写手)

[交流] 【求助】DS中CDOCKER的操作 已有3人参与

刚刚开始接触分子对接的问题，现在我刚刚学会libdock和flexible docking
我只知道CDOCKER也是一个柔性对接，但具体的操作时怎么样的？能给我介绍一下么？
在这种对接下，对小分子是怎么处理的，我只是在chemdraw中画了个分子，贴了上去，好像不行啊。

[ Last edited by puffy581 on 2010-3-24 at 13:23 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2010-03-18 22:16:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
puffy581(金币+2):谢谢参与
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-03-29 14:41
CDOCKER是半柔性对接吧，我也是刚接触CDOCKER，在protocol下有一个generate  conformation，用这个用该可以吧，它会自动生成很多构象。用chemdraw画完后，保存成mol格式。你的结合位点已知吗？要是已知的话，直接找到结合位点，定义成sphere后，就可以对接了。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-03-29 13:55:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

susan09
★
puffy581(金币+2):谢谢参与
先顶一下
3楼2010-03-29 15:55:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingkanglee

新虫 (正式写手)
★
puffy581(金币+2):谢谢参与
太专业，帮你顶
回复此楼
两岸共同市场就是一中市场。
4楼2010-03-29 20:16:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingjun

木虫 (小有名气)
★ ★
puffy581(金币+2):谢谢参与
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-07 09:54
对，就是这样的，活性和你的小分子先优化一下，在对接过程中应该还会进行构象搜索的
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-04-07 08:59:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CADD

银虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1):谢谢 2010-04-07 10:15
还有就是，在做对接之前，一定要给你的蛋白质赋力场，这一点很重要。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-04-07 10:10:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

puffy581

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by CADD at 2010-04-07 10:10:28:
还有就是，在做对接之前，一定要给你的蛋白质赋力场，这一点很重要。

谢谢你
回复此楼
7楼2010-04-07 10:43:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 puffy581 的主题更新
71/1返回列表
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴，则可能无法领取此贴金币
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-11 04:54 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:29 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 5/250 2026-11-11 04:23 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:12 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 6/300 2026-11-11 04:10 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 03:59 by Z7qfCsdIiD1T
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:54 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:32 by Z7qfCsdIiD1T
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:21 by Z7qfCsdIiD1T
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 6/300 2026-11-11 01:02 by Z7qfCsdIiD1T
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 5/250 2026-11-11 00:59 by Z7qfCsdIiD1T
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 FChKX8meu1ds 2026-11-09 4/200 2026-11-10 20:51 by Z7qfCsdIiD1T
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 4/200 2026-11-10 01:29 by FChKX8meu1ds
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭