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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】急!!关于comfa晶体结构的处理

俄在做一组化合物的comfa当中,找到了母核的晶体结构,在高斯里以晶体结构为母板,画这组化合物,并用高斯的PM3优化了
            

            可不可以把优化后的结果当作是Sample Text最优构象
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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)


绿茶QJM(金币+2): 2010-03-14 12:56
lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-14 12:57
绿茶QJM(金币+1): 2010-05-04 10:53
最优构象是你在数据集有最好统计指标的构象,并不一定是现在优化后的构象
2楼2010-03-14 11:32:32
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

是的,呵呵,我现在把画好的结构,MINIMIZE后再做

     结果,好了很多,上了0。5,也看到有篇文献用了类似方法
   
                  不知道,还有没有其它的好方法呢?
3楼2010-03-14 12:58:43
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-14 15:00
绿茶QJM(金币+1): 2010-05-04 10:53
可以先做DOCK,然后把优化后的构象来做COMFA,有许多类似工作的报道。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2010-03-14 13:52:37
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