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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助】急！！关于comfa晶体结构的处理

俄在做一组化合物的comfa当中，找到了母核的晶体结构，在高斯里以晶体结构为母板，画这组化合物，并用高斯的PM3优化了

可不可以把优化后的结果当作是Sample Text最优构象

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1楼 2010-03-14 10:01:19

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piscesee

铁杆木虫 (正式写手)

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★
绿茶QJM(金币+2): 2010-03-14 12:56
lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-14 12:57
绿茶QJM(金币+1): 2010-05-04 10:53

最优构象是你在数据集有最好统计指标的构象，并不一定是现在优化后的构象

赞一下(1人)

2楼2010-03-14 11:32:32

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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

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是的，呵呵，我现在把画好的结构，MINIMIZE后再做

结果，好了很多，上了0。5，也看到有篇文献用了类似方法

不知道，还有没有其它的好方法呢？

3楼2010-03-14 12:58:43

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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

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lei0736(金币+1):谢谢 2010-03-14 15:00
绿茶QJM(金币+1): 2010-05-04 10:53

可以先做DOCK，然后把优化后的构象来做COMFA，有许多类似工作的报道。

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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。

4楼2010-03-14 13:52:37

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