24小时热门版块排行榜    

查看: 665  |  回复: 5
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

准博士

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】到底问题出在哪?

最近开始做一个关键酶的基因,本来16s rDNA鉴定出来与一个菌的同源性有98%
,并且我们的目的产物是同一个家族的高分子多糖。我就用的那个已经菌的已经酶的基因设计的引物,想直接钓基因。可是,重复了几次实验,特异性都不强,条带很多,目的条带很淡,甚至没有,也调整了模板的浓度,引物的浓度,还有退火温度,还是不行啊,急啊,等着毕业。
想请教大家:
(1)同源性98%的菌可不可以这样设计引物,我之前也用过简并引物的方法,但是没有扩到过想要的东西,那个实验做了半年,没有出来想要的片段
(2)这个学期刚刚开始,菌种鉴定,然后设计基因,怎么还是扩不出东西来?
(3)一个很简单的最基本的分子实验,怎么到我这就这么难啊?
  难道是我的基因组的问题?还是其它的原因,我真是无语了。请高人指点
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xhy0016

金虫 (小有名气)

准博士(金币+2): 2010-03-15 22:30
我觉得同源性是很高,但是基因都是有特异性的,引物同样如此。如果这个引物对其他的非目的基因的特异性更强,那么,你就不可能得到足够的目的基因。建议你还是去再设计一个引物,毕竟快毕业了嘛。祝你顺利毕业!
4楼2010-03-14 14:19:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

yujiaping1

木虫 (著名写手)

准博士(金币+1): 2010-03-15 22:30
准博士(金币+1): 2010-03-15 22:31
同源性98%,肯定没有必要设计简并引物了,如果一对引物扩增不出来,我觉得可以再设计一对试试,同时,可以将引物组合起来,跑巢式PCR,可以增加特异性,一般巢式PCR出来的可能性非常大
2楼2010-03-12 17:06:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mxbeaver

木虫 (著名写手)

浪滔滔~人渺渺~

准博士(金币+2): 2010-03-15 22:30
16s rDNA的同源性98%,并不算高。同一个属的菌99%或100%都有。
“目的产物是同一个家族的高分子多糖”是菌所产的酶的产物?即使作用底物和产物一样,酶也有可能是不同的两个酶
3楼2010-03-13 10:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

love_st

金虫 (著名写手)


准博士(金币+1): 2010-03-15 22:30
是不是你的引物错配的比较严重?
5楼2010-03-14 14:59:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 7/350 2026-11-13 10:55 by Equinoxhua
[考博] 27博士 +5 锦鲤送福至 2026-11-10 5/250 2026-11-13 06:22 by wlf1982
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:51 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:48 by ECLTXnJnRSXf
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 5/250 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:11 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:03 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-12 10:38 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:36 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 11/550 2026-11-12 09:57 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 08:15 by HajghKOMynmz
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:53 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 7/350 2026-11-12 05:39 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-12 05:19 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:08 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 0TEMgxdT1eIw 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:00 by 9fOTqj074tIg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 7/350 2026-11-12 00:44 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 6/300 2026-11-11 17:03 by TgvkbZZl9tqB
信息提示
请填处理意见