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zhanping

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】gaussian输出结构变形

我算的L-Threonine(L-苏氨酸)分子,之前画了一个,算了1-3THz,跟文章上的差太远,后在ccdc上找了一个,它是-NH3 、-C-COO-(C-O单键,我画的有个H:-C-COOH 、NH2少个H ),我画的是根据百度图,但我看了文章的参考数据和图,就是ccdc上的这个,就直接算了,可是算完后-C-COO中两个C-O为双键了,-NH3的一个键断了!IR结果还是不对!
     老是出现这种.out文件跟输入文件键不一致的问题,.CHK文件倒是对的,但我想这肯定会影响IR频率计算吧。请教该采取什么方法?或输入参数问题。
     千万千万的要帮忙。
     先谢过!
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


zhanping(金币+1):谢谢参与
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
这个帖子的第三章第一节
4楼2010-03-05 13:11:03
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lwei7336

木虫 (小有名气)


zhanping(金币+1):谢谢参与
成键类型要靠自己分析,gaussview的成键标准很粗糙的,就是看原子半径
2楼2010-03-05 09:00:52
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zhanping

金虫 (正式写手)

"成键类型要靠自己分析"

   自己肯定知道该成什么键,可怎么分析?结果都出来了.
3楼2010-03-05 10:50:52
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zhanping

金虫 (正式写手)

这一章我有看过,是说打开初始文件和.chk文件无恙,我照做了,是这样。可是.out文件的结构键关系改变了(相对输入文件),我就对所算的IR有怀疑。
  难道只要.CHK没事,就没事。还是说我的结构太差。
  还请再指教!

[ Last edited by zhanping on 2010-3-5 at 23:03 ]
5楼2010-03-05 22:54:02
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