24小时热门版块排行榜    

查看: 798  |  回复: 5
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 zhanping 的 5 个金币 ,回帖就立即获得 1 个金币,每人有 1 次机会

zhanping

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】gaussian输出结构变形

我算的L-Threonine(L-苏氨酸)分子,之前画了一个,算了1-3THz,跟文章上的差太远,后在ccdc上找了一个,它是-NH3 、-C-COO-(C-O单键,我画的有个H:-C-COOH 、NH2少个H ),我画的是根据百度图,但我看了文章的参考数据和图,就是ccdc上的这个,就直接算了,可是算完后-C-COO中两个C-O为双键了,-NH3的一个键断了!IR结果还是不对!
     老是出现这种.out文件跟输入文件键不一致的问题,.CHK文件倒是对的,但我想这肯定会影响IR频率计算吧。请教该采取什么方法?或输入参数问题。
     千万千万的要帮忙。
     先谢过!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwei7336

木虫 (小有名气)


zhanping(金币+1):谢谢参与
成键类型要靠自己分析,gaussview的成键标准很粗糙的,就是看原子半径
2楼2010-03-05 09:00:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanping

金虫 (正式写手)

"成键类型要靠自己分析"

   自己肯定知道该成什么键,可怎么分析?结果都出来了.
3楼2010-03-05 10:50:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


zhanping(金币+1):谢谢参与
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146
这个帖子的第三章第一节
4楼2010-03-05 13:11:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhanping

金虫 (正式写手)

这一章我有看过,是说打开初始文件和.chk文件无恙,我照做了,是这样。可是.out文件的结构键关系改变了(相对输入文件),我就对所算的IR有怀疑。
  难道只要.CHK没事,就没事。还是说我的结构太差。
  还请再指教!

[ Last edited by zhanping on 2010-3-5 at 23:03 ]
5楼2010-03-05 22:54:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

c111999

铜虫 (小有名气)


zhanping(金币+1):谢谢参与
zhanping(金币+2): 2010-03-09 16:00
引用回帖:
Originally posted by zhanping at 2010-03-04 23:40:33:
我算的L-Threonine(L-苏氨酸)分子,之前画了一个,算了1-3THz,跟文章上的差太远,后在ccdc上找了一个,它是-NH3 、-C-COO-(C-O单键,我画的有个H:-C-COOH 、NH2少个H ),我画的是根据百度图,但我看了文章的参考 ...

1。是否优化结构了?
晶体结构直接计算可能会出现很大误差,
以晶体结构为基础优化未必能够收敛:伸直会出现分子碎裂
2。如果是重复前人计算结果,那么如果用了同样的结构就应该得到同样的结果
6楼2010-03-05 23:33:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhanping 的主题更新
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴,则可能无法领取此贴金币
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 8/400 2026-08-02 15:01 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 14/700 2026-08-02 14:58 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 18/900 2026-08-02 14:52 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +7 archvillain 2026-08-02 9/450 2026-08-02 14:36 by biomichael
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 12/600 2026-08-02 13:43 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +17 低垂的野花 2026-07-31 23/1150 2026-08-02 13:41 by RRRKKK
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 16/800 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 14/700 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 21/1050 2026-08-02 10:56 by iaeyuan
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 10/500 2026-08-02 10:00 by 锦衣卫寒战
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 7/350 2026-08-02 07:59 by 88817753
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
信息提示
请填处理意见